清洗消毒前，清洗消毒人员要着专用的洁净工作服、鞋、橡胶手套等，并备有照明用具和清洗专用工具进入水箱，消毒操作时还应戴防护眼镜和口罩。使用的清洗消毒工具要专用，使用前经消毒清洁，不得对水箱造成污染。清洗消毒时，要先关闭进水阀门等阀门，将水箱中的水通过排水管排净。清洗消毒人员遵循先池顶后底，由里向外的原则，对水箱进行清刷除垢。
待内壁刷洗完毕后，清洗人员会打开排水阀，或用抽泥沙的水泵将池底的沉淀物直接排到下水道，然后用清水冲洗水箱，并配制消毒液，均匀洒在水箱内壁表面消毒，再用清水将水箱冲洗干净，会冲洗2-3次。整个清洗过程需要2-3小时。每次清洗水箱后，都会将水质样片送到疾控中心等检测单位进行检测，检测水箱里的水的余氯、浊度等指标，确保居民引用水安全。
生活饮用水箱（蓄水池）清洗消毒程序：1、清洗前通知住户。物业人员在该住宅楼主要出口处，张贴通知将清洗水箱时间注意事项书面通知住户，便于住户配和做好水箱清洗消毒工作。2、水箱的清洗。先打开水箱排污阀，代水箱水位降到30公分时关上排污阀，然后，清洗人员穿戴长筒的雨靴，方可进入水箱，再用工具降水箱的出水口堵住，防止清洗后的污水流入管网，并用铲子、刷子、消毒毛巾，从上到下仔细清洗水箱内壁及浮球等部位，待达到清洗质量标准后用高压水枪对水箱内壁等部位进行冲洗，清洗干净后将污水排出，别忘将出水口打开。
