微生物菌剂是指目标微生物(有效菌)经过工业化生产扩繁后，利用多孔的物质作为吸附剂(如草炭、蛭石)，吸附菌体的发酵液加工制成的活菌制剂。这种菌剂用于拌种或蘸根，具有直接或间接改良土壤、***地力、预防土传病害、维持根际微生物区系平衡和降解***物质等作用。农用微生物菌剂恰当使用可以提高农产品产量、改善农产品品质、减少化肥用量、降低成本、改良土壤、保护生态环境。
不可以贪图便宜选择过期产品，这样的生物菌含量很少，失去***，一般超过两年的生物菌肥要慎重选择。
二、根据jun种特性，选择使用方法。
建议大家在使用生物菌肥的时候，基施可用方法有：撒施、沟施、穴施，也可以撒施一部分，剩余部分可以穴施效果更佳。
不建议冲施生物菌肥，这样效果不佳，但是可以灌根，主要针对液体生物菌肥。
三、尽量减少微生物死。
施用过程中应避免阳光直射；蘸根时加水要适量，使根系完全吸附。蘸根后要及时定植、覆土，且不可与农yao、化肥混合施用，特别是现在很多菜农为防治根茎部病害，使用农yao灌根，如多菌灵、恶霉灵、***铜等药剂，***、***都能防治，但对菌肥中的有益菌也有杀灭作用，所以建议使用菌肥后不要再用农yao灌根。
四、为生物菌提供良好的繁殖环境。
菌肥中的jun种只有经过大量繁殖，在土壤中形成规模后才能有效体现出菌肥的功能，为了让jun种尽快繁殖，就要给其提供合适的环境。
1、适宜的PH值。一般菌肥在酸性土壤中直接施用效果较差，如硅酸盐***需要在PH7-8土壤中生存，所以要配合施用石灰、草木灰等，以加强微生物的活动。
2、微生物生长需要足够的水分，但水分过多又会造成通气不良，影响好气性微生物的活动，因此必须注意及时排灌，以保持土壤中适量的水分。
3、生物肥料中的微生物大多是好气性的，如根瘤菌、自生固氮菌、磷***等。因此，施用菌肥必须配合改良土壤和合理耕作，以保持土壤疏松、通气良好。
改良土壤的具体方法
向土壤中施入微生物肥料。微生物的分泌物能溶解土壤中的磷酸盐，将磷素释放出来，同时，也将钾及微量元素阳离子释放出来，以键桥形式***团粒结构，消除土壤板结。
改善土壤，种植有机农作物。为土壤补充丰富的有机质以及养分。施肥不是给农作物施肥，而是给土壤施肥，很多人为了加快农作物生长，误认为多施肥有助于作物的生长。
补充土壤中的有机肥。土壤中有机物质补充不足，土壤有机质含量偏低、结构变差，影响微生物的活性，从而影响土壤团粒结构的形成，造成土壤的酸碱性过大或过小，导致土壤板结。土壤改良多用有机肥，肥力和土壤中有机质的含量有很大关系，而有机肥就可以为土壤补充丰富的有机质以及养分。
土壤温度：菌剂中的生物菌一般在土壤18-25℃时生命活动***活跃，15℃以下时生命活动开始降低，10℃以下时活动能力已很微弱，甚至处于休眠状态。因此，在阴雨天大棚蔬菜施入菌肥后，要注意调控好地温。首先控制好棚内的气温，以气温促地温回升。
土壤酸碱度：土壤偏酸或偏碱都不利于生物菌的生长繁殖，土壤pH值在6.5-7.5之间时***适合生物菌的繁殖。菜农可根据土壤的情况进行改善，让土壤pH值达到6.5-7.5，保证生物菌大量繁殖。
有些人觉得生物菌肥也能改善土壤索性就不管了，其实这种认知是片面的。生物菌肥并不能直接参与调节土壤酸碱度，主要作用还是利用生物菌改善微生态环境，算是土壤调理剂的一种，而土壤调理剂里面有专门调节酸碱度的，如果拿生物菌肥去调节土壤酸碱度，那就属于“大材小用”了。直接用在碱性的土壤里，也基本上等于是浪费了。