蛋白凝胶电泳的分类
蛋白凝胶电泳分为非变性凝胶和变性凝胶
所谓非变性凝胶，即在凝胶中不加SDS和尿素等变性剂，这种凝胶中，蛋白质仍保持活性，其迁移率受它的静电荷与分子大小两个因素的影响。因此在非变性凝胶中进行电泳是不能测得分子量的，常用于酶的鉴定、同工酶分析和提纯。
所谓变性凝胶，即在凝胶中加入变性剂，如尿素、SDS(十二***磺酸钠)、DTT等。这些变性剂可以***或改变蛋白质的结构，把绝大部分蛋白质分离成组成它们的亚基。同时在蛋白质分子周围包围了大量负电荷。这种电荷基本上掩盖了无变性剂存在时正常就有的任何电荷。蛋白质在这种变性凝胶中的迁移率与它们分子量的对数成直线关系。因此利用变性凝胶进行电泳可以测得蛋白质的分子量。目前应用较多的变性剂为SDS。
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为啥用琼脂糖呢，因为他有很多优点奥！
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琼脂糖的凝胶性是由存在的氢键所致，凡是能***氢键的因素都能导致凝胶性的***。琼脂糖具有亲水性，并几乎完全不存在带电基团，对敏感的生物大分子很少引起变性和吸附，是理想的惰性载体。天然琼脂（agar）是一种多聚糖，主要由琼脂糖（agarose，约占80%）及琼脂胶（agaropectin）组成。琼脂糖是由半乳糖及其衍生物构成的中性物质，不带电荷，而琼脂胶是一种含***根和羧基的强酸性多糖，由于这些基团带有电荷，在电场作用下能产生较强的电渗现象，加之***根可与某些蛋白质作用而影响电泳速度及分离效果。这也就是琼脂糖比琼脂贵那么多的原因了。
电泳技术与病毒
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不同大小的蛋白质和核酸可以通过聚丙烯酰胺凝胶和琼脂糖凝胶电泳分离开来。在多数电泳技术中，每一种蛋白质或者核酸会形成一个条带。电泳技术的原理在于不同分子量的分子在凝胶中移动速率不同。将大小未知的蛋白质或者核酸分子在凝胶中的位置与相同凝胶中大小已知的分子比较，就能估计未知分子的大小。SDS-PAGE是在聚丙烯酰胺凝胶中在SDS去污剂存在情况下屏蔽掉蛋白质带电不同，从而估计蛋白质分子量。
复杂的病毒成分可以按照双向电泳进行分离，即先按照蛋白质等电点进行分离（等电聚焦电泳），再依据蛋白质分子量进行第二向的分离（SDS-PAGE）。
核酸或者蛋白质经过电泳分离的谱型可以通过将其从凝胶上转移（印迹）到一层固相膜上。如果转移的是DNA，就叫sourthern印迹技术，用以纪念它的发明者Edwin Southern；如果是RNA分子，就叫Nouthern blot，如果是蛋白质分子就是Western Blot。
