研究层析现象而发展的塔板理论，与有机化学实验中的分馏法原理有些相似。被分馏的有机溶1剂在分馏柱内的填充物上形成许多热交换层，从而把低沸点溶1剂先分馏出来，达到纯化的目的。在层析时用理论塔板数n来衡量层析效能。tR为物质在层析柱上的保留时间，W为洗脱下来的物质峰形的宽度。n值愈大表示层析柱的效能愈高。如用理论塔板高度H表示，则包含了层析柱长度的因子。式中L为层析柱的柱长。H值越大，则柱效越低。此外影响层析分离效果的还有涡流扩散、纵向扩散和传质阻抗等因素。因此选择层析固定相支持物的粒度、均匀度等物理性能，流动相的层析系统和温度等都是做好层析的关键。
超高1效液相色谱法的原理与高1效液相色谱法基本相同，所改变的地方有以下几点：小颗粒、微粒固定相的出现。 高1效液相色谱的色谱柱，例如常见的十八***硅胶键合柱，它的粒径是5um，而超高1效液相色谱的色谱柱，会达到3.5um，甚至1.7um。这样的孔径更加利于物质分离（2）超高压输液泵的使用。由于使用的色谱柱粒径减小，使用时所产生的压力也自然成倍增大。故液相色谱的输液泵也相应改变成超高压的输液泵。（3）高速采样速度的灵敏检测器。（4）使用低扩散、低交叉污染自动进样器。配备了针内进样探头和压力辅助进样技术；（5）仪器整体系统优化设计。色谱工作站配备了多种软件平台，实现超高1效液相分析方法与高1效液相分析方法的自动转换。
超高1效液相色谱法的原理与高1效液相色谱法基本相同，所改变的地方有以下几点：小颗粒、微粒固定相的出现。 高1效液相色谱的色谱柱，例如常见的十八***硅胶键合柱，它的粒径是5um，而超高1效液相色谱的色谱柱，会达到3.5um，甚至1.7um。这样的孔径更加利于物质分离（2）超高压输液泵的使用。由于使用的色谱柱粒径减小，使用时所产生的压力也自然成倍增大。故液相色谱的输液泵也相应改变成超高压的输液泵。（3）高速采样速度的灵敏检测器。（4）使用低扩散、低交叉污染自动进样器。配备了针内进样探头和压力辅助进样技术；（5）仪器整体系统优化设计。色谱工作站配备了多种软件平台，实现超高1效液相分析方法与高1效液相分析方法的自动转换。与传统的HPLC相比，UPLC的速度、灵敏度及分离度分别是HPLC的9倍、3倍及1.7倍，它缩短了分析时间，同时减少了溶剂用量降低了分析成本。不过由于实验过程中仪器内部压力过大，也会产生相对应的问题。例如泵的使用寿命会相对降低，仪器的连接部位老化速度加快，包括单向阀等部位零件容易出现问题等。
如今，超液相色谱仪主要应用于（1）分析 如天然产物中复杂组分的分析（2）生化分析 如蛋白质、多肽、代谢组学等生化样品（3）食品分析 如食品中残留的检测（4）环境分析 如水中微囊藻的检测（5）其他 如化妆品中的检测
