随着老城区保护的开展，对原有四合院进行了改造，例如1990年由清华大学吴良镛教1授主持的对北京菊儿胡同四合院的危改项目，在保留院落结构的基础上，将原有四合院的平房改为楼房，增加了厨房、卫生间等设施。正式的四合院，一户一宅，平面格局可大可小。房屋主人可以根据土地面积的大小、家中人数的多少来建造，小到可以只有一进，大可以到三进或四进，还可以建成两个四合院宽的带跨院的。小者，房间为13间；一院或二院者，房间为25间到40间。厢房的后墙为院墙，拐角处再砌砖墙。一般而言，大宅院中，一进为门屋，第二进是厅堂，第三进或后进为私室或闺房，是妇女或眷属的活动空间，一般人不得随意进入，难怪古人有诗云:"庭院深深深几许"。庭院越深，越不得窥其堂奥。
两进四合院分为前院和后院，后院又叫作内宅。前院由门楼、倒座房组成，连接前后院的一般为垂花门，一些相对朴素的住宅则用月亮门，后院由东西厢房、正房、游廊组成。也有的两进四合院，四合院历史悠久，早在3000多年前的中国西周时期就有完整的四合院出现。陕西岐山凤雏村周原遗址出土的两进院落建筑遗迹，是中国已知***早、***严整的四合院实例。随着老城区保护的开展，对原有四合院进行了改造，例如1990年由清华大学吴良镛教1授主持的对北京菊儿胡同四合院的危改项目，在保留院落结构的基础上，将原有四合院的平房改为楼房，增加了厨房、卫生间等设施。
到了现代，水、暖气等卫生设施没有进入四合院，沦为大杂院的四合院也未继续改进以适应汽车、空调等设备的需要。完整的四合院为三进院落，一进院是垂花门之前由倒座房所居的窄院，第二进院是厢房、正房、游廊组成，中华人民共和国建国后，北京的很多四合院沦为了大杂院，而改革开放后随着城市改造的开展，很多传统四合院被拆毁，如1998年拆除康有为的粤东新馆，2000年拆除赵紫宸故居，2004年拆除孟端胡同45号的清代果郡王1府，2005年拆除曹雪芹故居，2006年拆除唐绍仪故居。与此同时，一些四合院被列入北京市和各区县级的保护院落。
影壁墙的顶一般和屋顶一样，虽然是砖砌，影壁的顶也用砖雕出椽子，并在上设清水脊或卷棚脊的屋顶。大四合院从外边用墙包围，墙壁高大，不开窗户，以显示其隐秘性。从制式上来说，许多王1府和寺庙也是按照四合院的布局进行设计和建造的。在古代，四合院基本上满足了一家人生活的需要，那时两进四合院以及更大的四合院通常是官宦和士绅的住所。
