通过微生物发酵技术，可将豆粕中目前已知的胰蛋白酶***因子、大豆寡糖、大豆球蛋白、植酸、脲酶、非淀粉多糖(NSP) 等多种抗原进行降解，使这些抗营养因子含量降低或被完全消除。采用植物乳固态发酵豆粕，对豆粕中抗营养因子进行降解，结果表明，大豆胚芽粉图片，豆粕中尿素酶活性由原来的0.373 U/g 降低到0.166 U/g，胰蛋白酶含量由原来的40.42 mg/g 降低到18.01 mg/g。Hirabayashi 等使用宇佐美曲霉发酵大豆粕，发酵后植酸全部被降解。江永才的研究表明，发酵可使基料粗纤维含量降低12% ～ 16%。
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氨基酸组成和含量也有一定变化和提高。除蛋白质以外，普通豆粕经过发酵后的其他常规指标也发生了相应的变化。综合目前市场上的发酵豆粕产品， 经过发酵后，其粗灰分含量≤ 10%， 粗纤维含量≤ 7%，粗脂肪≤ 7%，水分含量≤ 12%。
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饲料加工方面，豆粕氨基酸平衡，不需要额外加入动物性蛋白即可满足家禽和猪对营养的需求。事实上豆粕已经被为是其他蛋白源比较的基准品。但是豆粕中在大量的抗营养因子，降低了豆粕的营养价值，大豆胚芽粉厂家生产，限制了其使用。
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