与传统的HPLC相比，UPLC的速度、灵敏度及分离度分别是HPLC的9倍、3倍及1.7倍，它缩短了分析时间，同时减少了溶剂用量降低了分析成本。不过由于实验过程中仪器内部压力过大，也会产生相对应的问题。例如泵的使用寿命会相对降低，仪器的连接部位老化速度加快，包括单向阀等部位零件容易出现问题等。
如今，超液相色谱仪主要应用于（1）分析 如天然产物中复杂组分的分析（2）生化分析 如蛋白质、多肽、代谢组学等生化样品（3）食品分析 如食品中残留的检测（4）环境分析 如水中微囊藻的检测（5）其他 如化妆品中的检测
色谱分离法 (Chromatography)，使溶液分批通过垂直的填充吸附剂固定床，将各种组分分离精制。色谱分离法 Chromatographic separation / Chromatography在工业上应用色谱分析原理分离性质近似组分的方法。使溶液分批通过垂直的填充吸附剂固定床，层析泵，将各种组分分离精制。色谱柱内的填充吸附剂是多孔的惰性固体，用非挥发性的惰性液体涂渍。被分离溶液的溶质与惰性液体有大小不同的溶解度。如果被吸附的物质是气体，发生“吸收”现象。如果被吸附的物质是液体，发生“萃取”情况。分离系数取数聚决于分配系数的大小。
色谱条件的选择
由于中药有效成分类型不同，性质各异，所以选择色谱条件是不同的。
一般生物1碱的分离可用硅胶或氧化铝柱色谱，对于极性较高的生物1碱可用分配色谱，而对季铵型水溶性生物1碱也可用分配色谱或离子交换色谱。
苷类的色谱分离往往决定于苷元的性质，如皂苷、苷，一般可用分配色谱或硅胶吸附色谱。
挥发油、甾体、萜类包括萜类内酯，往往氧化铝及硅胶色谱。
黄酮类化合物、鞣质等多元酚衍生物可用聚酰胺吸附色谱。
有机酸、氨基酸一般可选用离子交换色谱，有时也用分配色谱。有些氨基酸也可用活性炭吸附色谱。
对于大分子化合物，如多肽、蛋白质、多糖，常用凝胶色谱。
总的来说，对非极性成分往往考虑用氧化铝或硅胶吸附色谱；若极性较大则采用分配色谱或弱吸附剂吸附色谱；对酸性、碱性、成分可采用离子交换色谱，有时也可用吸附色谱及分配色谱等。
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