质谱仪真空泵的***方法，油受到污染时：取下加油孔的塞子，倒进干净的油。重新连上泵和电路的连接，开泵运转5-10分钟。断开泵和电路的连接，取下排油口的塞子，让油流出来。重复上述步骤直到将泵清洗干净。等几分钟直到油抽到泵中，需要的话，可再添油(需再关泵)。塞上加油孔的塞子。如果氦气纯度不够，杂质中可能含有部分氮气，在峰检测时氮气峰会略高。清洗马达风扇周围：关掉真空泵，断开其与电源的连接。利用干的布或毛刷清除电动机的风扇罩和围栏的污染物。
质谱仪的日常维护，清洗离子源。把离子源放在洁净的纸上，取下安装杆，分开排斥极套装和离子源盒。用研磨砂纸反复擦拭离子源盒的内部和两侧圆孔，擦拭排斥极的平面、侧边的圆周面，用洗耳球清除表面沙尘后，在丙1酮溶液中超声清洗30min，然后在400℃的马弗炉中老化一小时。除以上分类外，还可以从质谱仪所用的质量分析器的不同，将质谱仪分为双聚焦质谱仪、四极杆质谱仪、飞行时间质谱仪、离子阱质谱仪、傅里叶变换质谱仪等。组装排斥极套装，将排斥极安装在离子源盒上，把离子源安装杆拧紧到离子源盒上。
质谱仪的日常维护，当发现系统漏气时，必须找到漏气点。可以用进样针吸取少量石油1醚，依次***于进样口上部螺母、色谱柱两端接头和离子源前门处，并观察43质量数的峰高，如峰高明显增大，说明该部位有漏气。找到漏气点后，将其拧紧或重新连接好。质谱仪常见几种分类，其他有机质谱仪，主要有：基质辅助激光解吸飞行时间质谱仪、傅里叶变换质谱仪。调谐完成后要评价调谐报告：检查检测器电压是否超过1.5kV，与前一次调谐数据对比，相差0.2-0.3kV是可以的，如相差太大需重新调谐;
