提高化肥利用率的作用
随着化肥的大量使用，其利用率不断降低已是众所周知的事实。这说明，仅靠大量增施化肥来提高作物产量是有限的，更何况还有污染环境等一系列的问题。为此各国科学家一直在努力探索提高化肥利用率达到平衡施肥、合理施肥以克服其弊端的途径。微生物肥料在解决这方面问题上有独到的作用。所以，根据我国作物种类和土壤条件，采用微生物肥料与化肥配合施用，既能保证增产，又减少了化肥使用量，降低成本，同时还能改善土壤及作物品质，减少污染。
微生物肥料在环保中的作用
利用微生物的特定功能分解发酵城市生活垃圾及农牧业废弃物而制成微生物肥料是一条经济可行的有效途径。目前已应用的主要是两种方法，一是将大量的城市生活垃圾作为原料经处理由工厂直接加工成微生物有机复合肥料；二是工厂生产制微生物肥料(jun种剂)供应于堆肥厂(场)，再对各种农牧业物料进行堆制，以加快其发酵过程，缩短堆肥的周期，同时还提高堆肥质量及成熟度。另外还有将微生物肥料作为土壤净化剂使用。
改良土壤作用
微生物肥料中有益微生物能产生糖类物质，占土壤有机质的0.1%，与植物粘液，矿物胚体和有机胶体结合在一起，可以改善土壤团粒结构，增强土壤的物理性能和减少土壤颗粒的损失，在一定的条件下，还能参与腐殖质形成。所以施用微生物肥料能改善土壤物理性状，有利于提高土壤肥力。
微生物在活动中或死后所排出的物质，不只是氮、磷、钾等无机养分，还能产生谷酰氨酸、脯氨酸等多种氨基酸，多种***，还有细胞分裂素、植物生长素等植物ji素。少量的***与植物ji素，就可给作物的生长发育带来巨大影响。
提高解读效果，净化土壤环境，有机肥料有解读作用。例如：增施鸡粪或羊粪等有机肥料后，土壤中***物质对作物的读害可大大减轻或消失。
有机肥料的解读原因在于有机肥料能提高土壤阳离子代换量，增加对镉的吸附。同时，有机质分解的中间产物与镉发生螯合作用形成稳定性络合物而解读，***的可溶性络合物可随水下渗或排出农田，提高了土壤自净能力。有机肥料一般还能减少铅的供应，增加的固定。
而且***倡导使用有机肥料，改善修复因长久使用化学肥料对土地造成的***，而金宝贝有机肥发酵剂发酵肥料速度快，一般动物粪便三到五天即可彻底发酵完成，发酵好的有机肥料使用稳定养分充足，改善土壤、粮食增收、成本低廉等等诸多优势。