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由于起始物料对API质量的潜在影响，所以起始物料越在API的合成工艺中接近终API，越应该对其进行严格的控制。

例如，氟是API奥的关键起始物料。如果关键起始物料中存在2-4-二氟杂质，根据文献条件，将转化为8-氟奥，一种非药典杂质(美国药典[USP]方法，相对保留时间[rrt] 1.07)。2-4-二氟与氟一起进入下一阶段，在终阶段会生成类似化合物。另一个例子中，N-[6-(4-丁氧)己基)]苯(见图2)为选择性长效-2-受体激动剂沙美特罗主文件)中的起始物料。该在临床上作为吸入剂使用，用于和(5, 6)。

Impurities due to in situ reacti由于原位反应产生的杂质

合成化学的进步已经使得多步法反应只需一步或两步法进行，而无需分离中间体。此类反应的缺点是形成数量众多的预期外的杂质，这是因为没有对中间体和试剂进行分离。

例如，在四丁基化铵存在的情况下，使用使API坦的关键起始物料(S)-2 -氨基丁酰胺与氯丁酰氯烷化，产生中间体并终环化为坦。但是，该中间体作为USP杂质A存在于终产品中。

反应活性中间体，顾名思义，是由于反应的中间步骤而产生的副产物或杂质，有可能与随后阶段中使用的试剂或催化剂发生反应。它们作为反应活性中间体进入每一阶段直至终API中。

在沙美特罗工艺开发中，在2.08 RRT检测出一种未知杂质，其浓度为0.11%，经分离后确定为化合物3(见图2)。由于中间体2中存在的N-苄基-6-(4 -环己丁氧基)己烷-1-胺使得终API中形成的杂质，生成沙美特罗环己基杂质(12)。

反应活性中间体，N-苄基-4-丁烷-1-胺存在于中间体2中(见图2)。通过4-丁醇与苄胺反应形成，并在所有反应步骤中与中间体2竞争形成化合物4(见图2)。

开发API阿瑞吡坦烯化路线主要面临的挑战是随后乙烯醚中间体与双环戊二烯基二钛的反应形成杂质

品中 3个已知杂质 (A，B，D)高于上市品，且高于 ICH规定的可接受限度 0.1%；此外，两个未 知杂质 (RRT1.28和 1.31)也高于 0.1%。关于杂 质 A，缺乏试验和文献资料支持其安全性，故应改善工艺，降低其含量，使之不超过上市产品的限度；关于杂质 B，为一上市，有长期人用历史，文献资料显示其在体内可转化成主药，不存在安全性方面的担心，可接受目前的杂质水平；关于杂质 D，文献显示其为主药在人体的主要代谢产物，也不存在安全性担心；关于 RRT1.28和 1.31的未知杂质，因缺乏试验和文献资料支持其安全性，应改善工艺将其降低到未知杂质可接受的 0.1%限度以下。

杂质研究是药品研究的一项重要内容，贯穿于药品研发的始终。伴随着对药品研发规律的认知、 质量源于设计理念的不断拓展及新技术、新方法的不断涌现，杂质研究必将会有新的突破。