通过水溶肥在根系附近施用补充腐植酸、氨基酸、海藻酸等有机活性物质，能够与微生物进行信息交流和能量交换，进而***病原微生物的增加，减少作物土传病害的发生。此外，外源添加腐植酸、氨基酸等功能性有机物质，能够增加土壤团聚体，改善土壤孔隙度，改良土壤环境，提高作物抗逆性，进而促进作物根系的生长与对土壤养分的吸收。例如，根部施用32P经15昼夜后植株体内分布仅相当于叶施5分钟时的情况。
大棚或温室长期用滴灌施肥，会造成地表盐分累积，影响根系生长，可采用膜下滴灌***盐分向表层迁移。
注意施肥均匀性滴灌施肥原则上越慢越好，特别是对在土壤中移动性差的元素(如磷)，延长施肥时间，可以极大提高其利用率。旱季滴灌施肥，建议在2～3小时完成。土壤不缺水，在保证均匀度的前提下，越快越好。
避免过量灌溉一般使根层深度保持湿润即可，根层深度依不同作物差异很大，可以用铲随时挖开土壤了解根层的具体深度。过量灌溉不但浪费水，严重的会将养分淋洗到根层以下，浪费肥料，致使作物减产。特别是尿素、硝态氮肥(如、钙、硝基磷肥及含有硝态氮的水溶性肥)极容易随水流失。施肥过程中，为达到效果，要结合水溶性肥料的特点，掌握一定的施肥技巧。
灌溉水质了解灌溉水的硬度和酸碱度，避免产生沉淀，降低肥效。如果灌溉水pH值大于7，表明水偏碱性，可能会造成水溶性肥料中铵态氮的挥发损失。国外的做法是在灌溉水中溶解一定数量的***，将水调整到微酸性。如果水的硬度大，含钙镁高，加上水偏碱性，当施用水溶性磷肥时，可能会产生磷酸钙盐沉淀，这种沉淀一般过滤器不能过滤掉，肉眼也不方便观察到，微细的沉淀颗粒通过过滤器进入滴灌管道，慢慢沉积在滴头的流道内，累积到一定程度，堵塞滴头。这是很多盐碱土地区滴头堵塞的原因之一。同时磷酸盐沉淀也是降低水溶性肥中磷肥效果的重要原因。少量多次施用由于水溶肥性强,难以在土壤中长期存留,少量多次是的施肥原则,符合植物根系不间断吸收养分的特点,减少一次性大量施肥造成的淋溶损失。针对这种情况，建议采用酸性肥料，如磷酸尿素、***尿素、酸性水溶性肥等。