水溶肥料作为一种新型肥料，与传统肥料相比，不但配方多样，施用方法也非常灵活，可以土壤浇灌，让植物根部接触到肥料，尽情地呼吸各种营养元素；可以叶面喷施，通过叶面气孔进入植物内部，提高肥料吸收利用率；也可以滴灌和无土栽培，节约灌溉水并提高劳动生产效率。少量多次施用这是水溶性肥料的施肥原则，符合植物根系不间断吸收养分的特点，减少一次性大量施肥造成的淋溶损失。施肥过程中，为达到效果，要结合水溶性肥料的特点，掌握一定的施肥技巧。
根据生产障碍问题选择功能型水溶肥。改善和优化植物对营养和水分的吸收在碱性条件下作为一种天然螯合剂与金属离子促进其根部吸收。在苹果树肥料选择时可根据肥料的功能与特性进行选择。对于长期过量施肥而导致的果园土壤酸化问题，可选择酸性土壤调理剂进行改土，同时选择含腐植酸、氨基酸等功能型水溶肥，在改善土壤环境的同时提高苹果根系的活力，促进其对养分的吸收利用;对于土壤肥力低、有机质含量低的山地土壤，则可以釆用多施有机肥等措施进行培肥;而对于冬季严寒或是春季倒春寒等环境障碍因素，则可选择含海藻酸、腐植酸等功能型水溶性肥料产品进行灌根，以提高苹果的抗逆性。
大量元素水溶肥原料对氮肥的增效作用
大量元素氮肥多以碳酸和尿素为主，铵态氮性质不稳定，极易挥发，与腐植酸肥料混合后，因腐植酸含有羧基、酚羧基等官能团，有较强的离子交换能力和吸附能力，可以减少铵态氮的损失。
大量元素水溶肥原料对磷肥的增效作用
磷肥施入土壤，可溶性磷很容易被土壤固定，在酸性土壤中，磷主要被游离的铁铝离子固定;在石灰性土壤中，磷主要被钙固定，结果使磷转化为迟效磷甚至无效磷，当季磷利用率只有10-20%。研究表明，一些有机物质(如腐植酸、氨基酸、***等)由于其特殊的官能团，导致特殊的生理功能，从而影响作物抵抗逆境的能力。增施腐植酸类肥料后，能仰制土壤对水溶性磷的固定，减缓磷向迟效、无效态转化，浆解的硝基腐植酸增加磷在土壤中的移动距离，促使根系对磷的吸收。
配合施用
水溶肥料为肥料,一般只能作为追肥。特别是在常规的农业生产中,水溶肥是不能替代其它常规肥料的。要做到基肥与追肥相结合、有机肥与无机肥相结合、水溶肥与常规肥相结合,以便降低成本,发挥各种肥料的优势。
尽量单用或与非碱性混用
蔬菜出现缺素症或根系生长不良时,不少农民多采用喷施水溶肥的方法加以缓解。在此提醒,水溶肥要尽量单独施用或与非碱性的混用,以免金属离子起反应产生沉淀,造成叶片肥害或药害。