微生物菌剂是一种微生物产品，含有多种高浓度高活性的有益微生物菌群，能通过土壤吸收养分，尤其是对钾和存在于磷酸盐（PO43-）中磷的吸收效果突出．并将这些养分转移给植物来弥补根部生长不良的缺陷。这些有益生物菌与植物形成一种共生关系，刺激植物根部的分枝并增大根部吸收面积，起到固氮、解磷、解钾、促进植物根系生长并保护植物不受致病菌侵害的作用。
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微生物菌剂主要作用：提高土壤肥力：有些菌剂可以增加土壤中氮磷钾营养元素的含量；还可以提高一些土壤酶类活性，有利于土壤中养分的转化方便植物的吸收利用。另外，在微生物菌剂的帮助下会产生大量的二氧化碳，可提高土壤保水、保肥能力。促进难溶的矿质营养释放：生物微生物菌剂使土壤酶活性提高，使不溶性土壤养分溶解利于植物吸收。同时，还分泌一些有机酸性物质，能分解有机质，产生的糖有利于固氮***的生长。
对地上部分营养体生长的影响，在养份供应充足的基础上，农业微生物菌剂，生物菌剂分泌的多肽类、酶类可刺激作用可使植株地上部分营养体生长旺盛，表现在株高、茎粗、叶片数、干物质积累等方面。生物菌剂对不同作物的产量、构成因素是不同的，复合微生物菌剂，对粮食作物，穗多、粒多、千粒重等起到增产作用，前期对分蘖、减少空秕率均有良好的效果。生物菌剂对作物的根系发育有特殊的促进作用，许多农科人员称生物菌剂为“根系肥料”，对根系的影响主要表现在，刺激根端分生***细胞的分裂与增长，微生物菌剂，使幼苗发根快，次生根增多，根量增加，根系伸长，终导致作物吸收水份和养份的能力大大增强。
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