一是由于工程成本的制约，一些中、小洁净工程设计和施工单位不按***标准施工，造成设计的洁净室不符合洁净厂房设计规范，无法满足企业生产的需要。二是将洁净室性能检测和测评工作混为一谈，有些企业认为完成竣工检测就可以投入生产，而忽视了洁净室的综合测评工作，这两者实施主体不同、检测内容不同，不可省略任何一个环节。三是洁净室本身的问题，洁净室打扫不彻底、不规范、洁净室通风设备不合理、洁净室布局不科学等。
净化工程装修过程中需要注意的事项空调的节能性：***空调的运行是非常耗电的，因此，在设计与施工时，应该注意节能性，增加一些节能的措施。质量方面：在净化工程运行的过程中，i风管的作用举足轻重，连接着净化室的内外，因此，另外方便生产，有利于各部门进行沟通;而消防设备是净化工程中必不可少的设备，因为净化室内的火情不易被外部发现，为了避免造成更大的损失，一些常用的消防设备必须配备。
与监理单位沟通及协调，在施工过程中，严格接受监理工程师的管理。安装的质量检验项目在自检后主动邀请监理工程师进行检查。按照要求将施工计划和完成情况定期地上报监理工程师。对施工中出现的问题或不合格项目，严格按照监理工程师的要求进行整改，直至达到要求为止。门窗位置留洞口及彩钢板与门窗交界处的细部处理工作。
传递窗分为标准传递窗和风淋传递窗。标准传递窗主要用于洁净室与非洁净室之间物品传递,以减少开门的次数，是有效减少洁净室与非洁净室交叉污染的净化设备。传递窗门均为双门互锁，（即一次只能打开一扇门，打开一扇门之后，另一扇门就不能打开）。 传递窗根据箱体材质不同可分为：不锈钢传递窗、外钢板内不锈钢传递窗等。传递窗还可选配杀菌灯（8W），对讲机等。
