空气分子控制主要应对空气分子污染(AMC)，工业洁净室施工，这类污染的控制要比粒子污染困难许多。说到粒子污染的控制，先要确定粒子的粒径与个数，然后才能进行相应的设计。只是对于空气分子污染，需要控制的除了芯片线宽外，还有工艺、设备、材料与传送系统等，所以这类污染的控制一直就是业界的难题。总体上来说，洁净室设计，正是因为很难有效控制空气分子污染，致使该问题成为了影响相关产品成品率的重要问题。
***检验实验室作为***厂QC检测的重要基地，一般由理化分析实验室、微生物实验室两个检验单元组成。其中理化分析实验室主要对所受到的原料、包装材料、中间体和成品进行理化鉴别、含量测定和其它检验，以确保它们符合法定要求和企业内部的质量标准；微生物实验室则是通过一系列试验，了解分析原料、包装材料、中间体和成品的微生物状况。QC实验室是质量管理部门的重要组成部分。
洁净实验室设计时，预先考虑和计算好机械设备占用面积很重要，在设计阶段，池州洁净室，要秉持灵活性原则，为未来发展需要做好准备，这样的实验室设计方案更利于进一步的扩张和修改，以及添加新设备和工具。洁净实验室设计要求墙壁管道系统可容纳较多的管道、电力设施。
洁净实验室设计要求气闸能帮助小化和防止可能影响工作流程的压力变化。因为洁净室内可能存在大量灰尘、污垢颗粒、***化学物质和其他污染物等。
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