磨光平板玻璃、钢化的磨光平板玻璃和有机玻璃是常用的透光材料。磨光平板玻璃通常只用于小型水族馆，因为它强度变弱时会成大片。通用的做法是给大型水箱配上2～3层钢化玻璃，即使碎了也只限于一层玻璃。有机玻璃容易被刮出擦痕，吉林海洋馆，但可重新磨光。
水箱的附属设备通常有过滤器、空气泵、灯光、电子恒温控制的浸入式加热器或其他降温装置。在水族馆内，水箱通常放在一起，因而可以有共用的过滤器和温度控制装置。也可能包括水的消毒器。在拥有多种系统的大型水族馆中，室内给排水设施有时很复杂，涉及各种自动控制装置和水质监控系统。玻璃管件（如︰水族馆内使水充气和循环的管件)因其成本高昂，性脆易碎，故只在必须保证低毒时才使用。广泛使用的是未增型的聚管。有时也用玻璃纤维管和衬以环氧树脂的石棉管，但铅管和硬橡胶管已废弃不用。在用海水的管道中会生长诸如贻贝和藤壶等造成淤塞的生物体，如用双套管道，隔周启用一套，这些生物体的生长即可避免，管道干燥后，海洋馆施工，管内的为数不多的生物体便，管道再次启用时，这些生物体就被冲洗出去。
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