充填站的充填系统是将充填料从制备、仓储、制浆到输送至充填区的各个环节或单元的总成。充填方法与充填料输送方法不同，充填系统的组成单元和功能不同。浓度低一些有利于长距离输送，但放料后易离析，泌水量大，加重排水负担，降低充填体的固化效果。就应用普遍的水力输送而言，一般包括充填料制备、充填料仓储、料浆制备与计量控制、管路输送等4个模块。金属矿山和煤矿充填在充填系统设计上差别很大，主要原因是充填料的不同。
目前选矿设备堆坝方法有三种，即上游法堆坝、中线法堆坝和下游法堆坝，我国大多用上游法堆坝，此方法操作简单，维护方便，但上游堆坝的坝体底部有一层较厚的细粒矿泥层，抗剪强度低，不利于坝体稳定，且堆积坝的侵润线水位较高，降低了坝体的稳定性，这些条件有可能限制选矿设备排出尾矿的堆坝高度。充填料要就近选择原则，要充分利用工业废渣，保护环境，降低成本。因此提出了中法堆坝和下游法堆坝，中线法和下游法均利用旋流器堆坝，旋流器的底流粗尾矿用来堆坝形成坝体，旋流器的溢流细尾矿排入坝体上游堆存，其主要支撑体粗尾矿筑成，所以坝体底部细粒层少，且侵润线水位低，有利于坝体稳定。
粉尘与噪声符合环保要求原则，充填站设置料仓或堆场，煤矿充填站，采用振动放料形式，过皮带传送至搅拌桶制浆。分级尾砂搅拌相对简单，全尾砂充填为避免细粒部分絮凝结团，需要采用强力活化搅拌技术。
要具备必要的防潮防雨雪措施，避免胶固材料吸潮结块，保持充填料稳定的含水率。
要保证仓储规模的正常生产，不能出现经常性断料。