可用于发酵的青、粗饲料及农作物加工副产品
将种植的豆科、禾本科牧草、农作物加工副产品等采用有益菌发酵，一是可方便储存；二是可大大降解粗纤维，提高饲料转化率，在产生大量生物性物质的同时，提高牛对饲料的消化、吸收功能。三是通过有益菌群分解转化后，可替代大部分精饲料。通过有益菌发酵饲料，从而达到以粗饲料为主，精饲料为辅的饲养方法。
发酵饲料的原料很多，按来源可分为：饼粕类，粮食加工厂的副产品类，微生物发酵加工厂的下脚料类，菌菇生产的基料，果蔬加工厂的下脚料类，植物的根、茎、叶类，畜禽屠宰场的下脚料类，水产品加工厂的下脚料类，薯渣类等。随着发酵饲料技术的日渐成熟及工艺设备的不断完善，更多的自然界产生的有机物及更多的加工副产物将成为发酵饲料的原料，利用率得到进一步的提高。
发酵饲料质量评定包括营养性、安全性和饲养价值这三个主要方面。要生产出质量佳且安全的饲料，需要对发酵这种多维过程进行适当的控制。在不适当或不受控制的发酵条件下，会损害饲料的卫生质量和营养价值。***菌检测包括肠科和霉菌，其标准应低于国标规定。乳酸、和乙醇等含量不宜过高，以避免对终产品的适口性和酸产生影响。
发酵饲料对肠道微生物的作用
人类和单胃动物的后肠含有数千种微生物，因此被认为是动物身体的另一个“系统”。饮食通常被认为是影响肠道微生物组成的重要因素之一，因为饮食成分的变化可能导致微生物群组成的快速变化。由于微生物群组成对宿主健康的许多方面有很大影响，因此它在维持健康方面起着重要作用。断奶引起的应激使得仔猪肠道内乳酸菌数量减少，大肠菌等***菌数量增多，***菌在肠道定植会引发仔猪腹泻等问题。
