潜水泵在使用前的选择非常重要，应根据水源的实际情况以及工作时间与泵水量等要求来选定水泵的型号。首先要选择扬程大于取水口与出水口的落差；其次是泵的流量要能够满足排涝和灌溉的要求。若充油式电动机绝缘电阻值低，则应对绕组进行烘干，并更换其内部的绝缘油。11千瓦以下的潜水泵允许直接启动。13千瓦以上的潜水泵应配备启动柜。来保护潜水泵的安全运行。为了避免潜水泵转子瞬间上窜及减小启动负荷。潜水泵启动时应把出口阀门行程关至3/4处。(留1/4气隙。以便放气)待启动出水后缓缓打开。至水泵工况点控制在适当位置。启动完毕开始运转后。应加强监护及观测水位变化。保证潜水泵在工况范围内运行。待潜水泵运行平稳后方可投入正式运转。潜水泵一次投入运行5小时后。停机迅速测量热绝缘电阻。其值不低于0.5MΩ。才能继续使用。
潜水泵电机接线必须接实，以免电机缺相运转烧毁电机。检查方法是将兆欧表上的一个接线柱接在电泵电缆线上，另一接线柱接在电机外壳上，摇动兆欧表，观察绝缘电阻值。电缆必须经常检查有无龟裂，擦伤等情况，有则及时更换或修补。油浸电机如果发生漏油现象，应及时到厂家或维修点修理，更换密封元件。水浸电机应经常清理电机腔内的砂粒，更换电机腔内清水。潜水电泵运行半年后，应维修检查，更换损坏零件。潜水电泵用后，水浸电机应放净电机内清水，将电泵清洗干净，涂油防锈，并竖直放在干燥处保管。
由于潜水泵的负载相对普通泵要重些，配套电机的额定电流相对也较大。玻璃钢过滤罐按其内部的滤料的不同可分为石英砂过滤罐，活性炭过滤罐，锰砂过滤罐等，可去除水中的悬浮物、有机物、泥沙、胶体等。因此，选择变频器时要依据电机的额定电流比照变频器的额定电流来进行选择，不能单单只是功率匹配。注意安装使用环境，对于安装于泵站等相对较潮湿现场的要做好变频器的防护。如，加强PCB线路板绝缘防护漆处理、螺丝钣金件的防护处理等、并放置控制箱内使用等。潜水泵一般深度在100米左右，变频器到泵之间距离较远。因此，在使用过程中要考虑加粗电缆线径减少线路损耗、选配输出电抗器减小线路漏电流，适当加大变频器选型以弥补功率衰减。尤其非清水泵含杂质更应加大选型，不在水里空载电流很大。
