进入无尘车间的所有人员，必须接受该阶段管理规定的培训，并佩带相应的胸徽（准入证）入室；进入无尘车间应穿干净鞋具，不得带油渍、污泥入内；室内不得吸烟、饮食和饮水；焊接、切割、凿洞等有尘作业必须加以控制，防止碎屑大范围扩散，每天工作结束时应将垃圾搬出室外倒入规定处；施工材料堆放整齐；室内严禁大小便有违犯以上规定者，应立即取消在无尘车间工作的资格。
车间排水的地漏要有防固形物进入的措施，畜禽加工厂的浸烫打毛间应采用明沟，以便于清除羽毛和污水。排水沟的出口要有防鼠网罩，净化车间的地漏或排水沟的出口应使用U 型或P型，S 型等有存水弯的水封，以便防虫防臭。
通风与采光，净化车间应该拥有良好的通风条件，如果是采用自然通风，通风的面积与净化车间地面面积之比应不小于1:16。若采用机械通风，则换气量应不小于 3 次/小时，采用机械通风，净化车间的气流方向应该是从清洁区向非清洁区流动。
施工中会出现各种矛盾，需要施工方与设计、建设方合作，在保证洁净室施工质量的前提下进行合理变更。如在对某洁净室改扩建工程检查中发现，原设计的风管尺寸在主体大楼楼层高度受限制的吊顶层内根本无法施工，后经施工方与设计人员和建设方协调，在不影响工程质量的前提下，将风管尺寸从方形变为扁形，既满足了风量要求，又保证了施工吊顶高度的要求。
