为防止洁净室外未净化空气渗入室内，同时也为了防止洁净室内的洁净空气向外渗漏，造成能量的浪费，甚至影响室内的洁净度。给排水管道穿过洁净室墙壁、楼板和顶棚时，应设套管，套管内管段不得有接头，管道和套管之间必须用不起尘的密封材料封闭。目前净化工程行业涉及如下：食品行业：奶制品、果汁、盐类、酿酒厂、肉类加工、烘焙面包房、槟榔厂、海鲜、调料包等。
排水管材的选择，应针对排水的水质特点选用。洁净厂房内管道的敷设方式直接影响洁净室的空气洁净度，因此管道应尽量在洁净室外。给排水管道穿过洁净室墙壁、楼板和顶棚时，应设套管，套管内管段不得有接头，管道和套管之间必须用不起尘的密封材料封闭。洁净厂房除了合理的工艺布局，恰当的室内装修，配套的安装工程设计亦至关重要，给排水工程设计就是其中一个重要的环节。
手是交叉污染的媒介，洁净厂房的工作人员在接触工作服之前应洗手，洗手的龙头不应直接用手开启，可采用感应式或肘式洗手龙头。洁净厂房内的生产工艺对环境有较高的要求，需要对其生产车间的空气悬浮粒子浓度进行控制，同时，还需保证一定的温度、湿度和压力。给排水管道穿过洁净室墙壁、楼板和顶棚时，应设套管，套管内管段不得有接头，管道和套管之间必须用不起尘的密封材料封闭。
