使用过程出现的问题原因及解决办法
（1）聚丙烯酰胺电泳时“皱眉”（两边向下中间鼓起）形带原因：聚丙烯酰胺电泳主要出现在蛋白质垂直电泳槽中，一般是两板之间的底部间隙气泡未排除干净。
处理办法：可在两板间加入适量缓冲液，以排除气泡。
（2）聚丙烯酰胺电泳带出现纹理现象：聚丙烯酰胺电泳主要是样品不溶性颗粒引起的。
处理办法：加样前离心；加适量样品促溶剂。
（3）聚丙烯酰胺电泳时出现“鬼带”：聚丙烯酰胺电泳时“鬼带”就是在跑大分子构象复杂的蛋白质分子时，常会出现在泳道顶端（有时在浓缩胶中）的一些大分子未知条带或加样孔底部有沉淀，主要由于还原剂在加热的过程中被氧化而失去活性，致使原来被解离的蛋白质分子重新折叠结合和亚基重新缔合，聚合成大分子，其分子量要比目标条带大，有时不能进入分离胶。污泥需要及时进行处理与处置，以免产生"二次污染"必要的处理处，置可以使污泥进行"资源化"利用。但它却于目标条带有相同的学活性，在WB反应中可见其能与目标条带对应的作用。
处理办法：在加热煮沸后，再添加适量的DTT或Beta，以补充不足的还原剂；或可加适量EDTA来阻止还原剂的氧化。
正常情况下，聚丙烯酰胺产品只要在降解失效的前提下，其粘度会变小直到较终消失。较常见的就是夏季因温度较高，静止时间的增加会导致其粘度变小甚至完全没有。
因产品离子类型的不同又有所不同，比如同样在高温下，阳离子聚丙烯酰胺降解失效的速度较快，有时甚至数小时就失去了粘度，而阴离子型和非离子型则长达数十天甚至上月。
这三个水处置工作中，阳离 子聚 丙烯酰胺的应用方法也是存在着差距的。应用聚丙烯酰胺絮凝沉淀法处置淀粉废水，具有占地面积小、***少、顺应性强、 把持大略、处置效率高、可调控空间大、对处置情况的请求小等特定。
聚丙烯酰胺效果发挥的好坏和它的溶解性有着密不可分的关系，只有让聚丙烯酰胺充分的溶解了，才能让它的有效物质充分发挥，这样才能让聚丙烯酰胺的效果发挥出来。