在操作室对钻探式抽沙船进行操作，当其开到目的地之后，启动动力部件，带动钻探刀头垂直向下对河床表层的土层进行分割***。然后由抽沙泵对河床底部的沙石进行抽取，沙石通过钻探管道进入洗沙设备，然后通过洗沙设备对沙石进行清洗分离，分离后的河沙直接在中舱进行堆放。当钻探式抽沙船满载之后，将船回航到河岸，搅动涡轮减速机，将船底舱门打开将沙子用射流泵抽到岸上。
特别需要注意的是抽沙船采用的作为挖沙动力的泵有两种，一种是专门用作挖沙的抽沙泵，另一种是砂砾泵。抽沙泵的抽沙深度深，扬程低，输送距离近，动力小，泥浆比重高；砂砾泵的抽沙深度较浅，养成高，输送距离远，动力大，泥浆比重低。钻探式抽沙船就是采用的抽沙泵，可以对深土层河床进行挖沙操作
抽沙船是一种依靠抽沙泵对河沙进行抽取的水上采沙设备，在这之前先依靠机械部分对河床进行***，使得河床底层的泥沙更好的同水流混合，抽沙泵将泥沙通过输沙管道输送到抽沙船上或者一定地点进行筛分和储运工作。抽沙船作为一种抽沙设备，其自身的功能决定其抽沙强度与抽沙效率。
当然除去抽沙船的本身构造和性能外，抽沙船的能否发挥自身的优势还与其所处的环境有关。首先是气候问题，我们都知道国内的结冰地域一般是以秦岭淮河线为基准的。北方的结冰期就不利于抽沙船的采沙工作。因此除做好抽沙船的防冻工作外，还要将抽沙船内部的冷却水放净，防止因结冰而导致冻裂。而南方虽然处于无冰期或者冰期过渡带，但是在冬季气温地下，也需要做好抽沙船的防冻工作。
绞吸式抽沙船在高度发达的技术上，除了用作采砂挖泥，更是成了人工岛吹填的先锋利器。从理论上而言，绞吸式抽沙船可以在几米到几十米的水下进行采砂作业。对于岩层、土层，绞刀都可以进行无间断的破碎。但是普通的设备只需要满足一般条件下的采砂作业就可以了，为了降低成本，很多零部件都选择适配当地的实际情况。
尤其是在应对积土层的河床的时候，很多用户都选择使用钻探式抽沙船，其实绞吸式抽沙船也可以。只不过从经济角度考虑，是否符合利益的大化。如果积土层只局限于一片区域，对整体的采砂环境并不构成影响，同或者积土层较薄，而下面的积沙层储量丰富，那么完全可以利用铰刀击穿积土层，然后利用高压水泵将河沙激起，然后在利用抽沙泵抽砂，这样依旧可以得到高品质的河沙。