在ISO9001认证阶段审核后，ISO9001认证机构会对***进行第二阶段审核，下面来介绍下二阶段审核一些知识：
一、第二阶段审核的目的
第二阶段审核的目的是评价受审核方ISO9001认证体系的实施情况，包括有效性。
二、第二阶段审核的依据
第二阶段审核应依据认证标准的要求并基于阶段审核的结果，对受审核方的管理体系进行的符合性、适宜性和有效性评价。
考虑到阶段审核中收集到的有关基础设施、工作环境、过程识别等信息，已得到审核组与受审核方的共同确认，第二阶段审核时可以直接采用上述相关信息，并在阶段审核的基础上进一步审核其运行、维护、保持的情况。
三、第二阶段审核的内容
1、与适用的ISO9001认证体系标准或其他规范性文件的所有要求的复合情况及证据;
2、根据关键绩效目标和指标(与适用的管理体系标准或其他规范性文件的期望一致)，对绩效进行监视、测量、报告和评审的情况;
3、受审核方的管理体系和绩效中与遵守***有关的方面;
4、受审核方过程的运作控制;
5、ISO9001认证内部审核及管理评审;
6、针对受审核方方针的管理职责;
7、规范性要求、方针、绩效目标和指标(与适用的管理体系标准或其他规范性文件的期望一致)，适用的***要求、职责、人员能力、运作、程序、绩效数据和内部审核发现及结论之间的联系。
如何提高ISO9001认证文件审核的质量，一般可以通过以下方法：
1、ISO9001认证文件审核应由***审核员或由审核组长***或审核组成员进行，而不应在公司中专门一部分人员进行文审或谁有空就安排谁进行文审，而且一个机构必须制定统一的文件审核准则。此外对该审核的内容必须进行审核。
2、对"方针"的审核，应着重把握是否满足标准有关"承诺"、"框架"的要求，是否有行业或企业的特色，是否体现了企业相关管理活动的宗旨和方面，是否体现了管理者的管理意图。
3、对"目标"的审核，应从系统性、性、协调性对***的整体目标进行评价，从ISO9001认证标准适宜性、合理性、可测量性和***的单一目标进行评价。
4、对"手册"的审核***审核手册是否明确了适用范围，是否通过文字/流程图/文字加流程图/图表等对过程及其相互作用进行了描述，是否给出了文件间的引用关系。对于相关活动是否考虑了相关******和强制性标准的要求，是否有产品或服务的特点。
5、对"程序文件"的审核，主要是审查文件是否体现了5W、1H的程序语言要求，文件是否可操作，文件与文件的接口处理如何。
ISO9001认证现场审核时可以从增值的角度，围绕体系运行的有效性和效率，对文件中不利提高管理的有效性和效率的内容提出改进的建议。
管理层要持续参与ISO9000认证体系运行
1、管理层要定期主持或参与质量例会。
2、管理层要利用各种场合宣讲有效开展质量管理体系运行的重大意义。
3、遇到问题时，管理层要严格按ISO9000认证体系文件规定办事。要真正做到"依法不依人"。
4、管理层要坚持每天到现场观察清洁生产和工艺纪律执行情况。
5、管理层要熟练掌握质量管理体系运行文件对每个过程规定的各项要求。
6、管理层要在参与质量管理体系运行中，做到既是"指挥员"又是"战斗员"。
7、管理层对ISO9000认证体系运行工作要常抓不懈。
8、当生产和质量出现矛盾时管理层要服从质量管理体运行的需求。
9、管理层要持续宣贯以顾客满意为中心的企业发展理念。
ISO9001:2008标准是一个管理体系标准，它通过建立ISO9001质量认证方针和目标并实现这些目标来达到对质量的指挥和控制，他关注的是使 与质量目标有关的实现结果适当地满足相关方的需求、期望和要求。ISO9000认证标准要求企业对其生产部门、岗位和每项工作都应确定活动的职责和顺序，规范其工作方法和程序，即进行标准化与规范化的管理。而HA***所关注的不是总体方针目标的制定和实现，而是通过进行危害分析、确定关键控制点、制定纠偏措施，以防止食品安全危害。这是两个不同层次的系统，其建立的思路、使用范围和评价要求均不同。
