无土栽培基质长时间使用后会聚积病菌和虫卵，尤其在连作条件下，更容易发生病虫害。因此，每茬作物收获以后，下一次使用之前一定要对基质进行消毒处理。
无土栽培与常规栽培的区别，就是不用土壤，直接用营养液来栽培植物。为了固定植物，增加空气含量，大多数采用砾、沙、泥炭、蛭石、珍珠岩、岩棉、锯木屑等作为固定基质。其优点可以有效地控制花卉在生长发育过程中对温度、水分、光照、养分和空气的要求。
无土栽培技术作为解决温室等园艺保护设施土壤连作障碍的有效途径被世界各国广泛应用，在我国设施园艺迅猛发展的今天，更具有其重要的意义，我国现有温室、大棚90万hm2之多，成为世界设施园艺面积大的***，但长期土壤栽培的结果，连作障碍日益严重，直接影响设施园艺的生产效益和可持续发展，适合国情的各种无土栽培形式在解决设施园艺连作障碍的难题中发挥了重要的作用，为设施园艺的可持续发展提供了技术保障。
无土栽培施用的是无机肥料，没有臭味，也不需要堆肥场地。常规土壤栽培施用有机肥，肥料分解发酵，产生臭味污染环境，还会使很多害虫的卵滋生，危害作物。无土栽培则不存在这些问题。室内种花，更要求清洁卫生，否则影响人们的生活质量。过去施用有机花肥，环境污染是个难以解决的问题，无土养花使问题迎刃而解。在现代化农业企业进行无土栽培时更省力省工、易于管理。无土栽培不需要中耕、翻地、锄草等作业，省力省工。
