蛋白质亚细胞定位对研究蛋白质的功能非常重要。如果用传统的电子显微法、荧光显微法等进行亚细胞定位，要耗费大量的人力物力。但是其实目前已经有非常多的软件和网站可以直接根据蛋白的序列，预测出所属的亚细胞位置。在体内，关键酶的活性受到代谢物(包括ATP，ADP)和(如胰岛素和胰素)等的周密调控。比如：targetP、SubLoc、WoLFPSORT等……武汉迈斯普生物科技有限公司是一家专业从事生物医学技术服务、技术咨询及产品开发的生物技术服务企业。公司坐落于武汉光谷，由3位归国博士领衔创办。公司长期致力于建立并完善多项基础生物技术服务平台。现凭借自身技术特色，依托光谷生物城技术产业优势，面向全国提供的生物技术服务。
实验用途：因为蛋白的功能和位置是对应的，例如一个光合作用相关的蛋白一定要定位在叶绿体内，所以通过亚细胞定位技术服务研究可以进一步佐证出目标蛋白的功能。进而促进了人类细胞图谱（HumanCellAtlas）项目的大胆落实。实验流程：实验细节沟通——订单/实验材料确认，签订合同——全基因合成或者基因*(如果客户未提供测序完成的目标基因)——实验设计——过表达载体构建——遗传转化/瞬时转化——激光共聚焦观察拍摄照片亚细胞定位（后两步为可选项）
蛋白质亚细胞定位的工具现在已经很了，但是基本的理论近年来没有重大突破，预测结果也需要实验验证。比较好的工具有ProteomeAnalyst (个人感觉较准的，但是有些蛋白预测不出来)，pTarget，WolfPsort，Nucleo（针对核定位），TargetP。不同工具特性也不太一样。可以参考一下工具的发表时间和发表杂志的分量，然后把各种工具的结果综合一下。可检索细胞器及其子结构蛋白组、单一或者多重定位的蛋白数据、不同细胞之间差异表达蛋白等等信息。