豆科植物首先分泌类黄酮诱导根瘤菌合成结瘤因子，结瘤因子被植物根毛细胞识别后引起一系列的根毛反应，如诱导根毛弯曲、******以及侵染线的形成、皮层细胞分裂、根瘤原基开始形成等，根瘤菌从分支的侵染线中释放，进入根瘤原基细胞中，内化的***被宿主植物生物膜包裹，从而形成密闭的空间，称为类菌体，它是固氮根瘤菌的分化形式。根瘤原基发育成根瘤，形成固氮共生体。
根部是植物的水分和营养吸收的关键器1官，同时也是很多土壤病原菌侵染植物的主要部位，目前已有较多对根际微生物群的研究。这些研究发现根际微生物可以从多方面影响植物的生长和应对不同环境胁迫。例如一些水稻品种可以特异性富集土壤中的某些***，这些***会促进植物对氮元素的吸收和利用，从而促进植物生长。
发展高1效、安全的新型遗传转化方法，一直是***工程、分子生物学和遗传育种等领域的研究热点之一。传统的植物转***方法，通常需要比较繁杂的***培养等植物再生程序，才能获得转***植株，尤其像诸如棉花等难再生作物的转***植物制备更加困难。