益生元与益生菌都会影响肠道菌群的平衡，但影响的方式完全不同，关键区别在于益生元作用于本已存在于肠内的菌群，而益生菌是外部添加的***。益生元以未经消化的形式进入胃肠道，通过降低pH促进双歧等有益菌的生长，间接地促进胃肠道健康和营养素的吸收。在胃部强酸性的环境下，外来***的存活性会受到考验，因为只有活着进人胃肠道的有益菌才能发挥***，有的益生菌株不能经受胃酸（强酸环境）和肠液（碱性环境）的腐蚀，而益生元不是生物，所以不存在存活率的问题。
人们发现益生元只有30多年的时间。1983年日本人发现功能性低聚糖不能被***消化却能被肠道内***选择性利用的特性后，同年，明治药业就实现了功能性低聚糖的工业化生产，1989年就出现了一款含有益生元的饮料，益生菌有哪些，并且迅速风靡日本。我国自1990年以来，低聚异麦芽糖、低聚果糖、低聚半乳糖等功能性低聚糖相继开发生产。
1997年，年产3 000 t纯度为50%液体低聚果糖生产线在云南投产，这是我国个工业化生产的益生元产品。经过十几年的发展，特别是以公众营养改善益生元项目启动为标志，江门益生菌，我国的益生元产业进入高速发展期。
调节、。益生元可被双歧、乳酸等有益菌群利用产生代谢产物，而代谢产物反之又能促进其消化、生长和增殖，从而刺激了肠道生长，益生菌哪个好，提高巨噬细胞的活性，提高了机体的水平。对低聚糖类益生元的调节作用检验证明，低聚糖多具有明显提高形成细胞数及NK细胞活性，增强功能的作用。大量动物实验表明，双歧在肠道的大量增殖有作用，这种作用归功于双歧的细胞，细胞壁和细胞间的物质使机体的提高。
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