使用过程出现的问题原因及解决办法
（1）聚丙烯酰胺电泳时“皱眉”（两边向下中间鼓起）形带原因：聚丙烯酰胺电泳主要出现在蛋白质垂直电泳槽中，一般是两板之间的底部间隙气泡未排除干净。
处理办法：可在两板间加入适量缓冲液，以排除气泡。
（2）聚丙烯酰胺电泳带出现纹理现象：聚丙烯酰胺电泳主要是样品不溶性颗粒引起的。
处理办法：加样前离心；加适量样品促溶剂。
（3）聚丙烯酰胺电泳时出现“鬼带”：聚丙烯酰胺电泳时“鬼带”就是在跑大分子构象复杂的蛋白质分子时，常会出现在泳道顶端（有时在浓缩胶中）的一些大分子未知条带或加样孔底部有沉淀，主要由于还原剂在加热的过程中被氧化而失去活性，致使原来被解离的蛋白质分子重新折叠结合和亚基重新缔合，聚合成大分子，其分子量要比目标条带大，有时不能进入分离胶。分批投药聚丙烯酰胺絮凝剂，在处理高浊水中，分批投药比一次投药的絮凝效果为佳。但它却于目标条带有相同的学活性，在WB反应中可见其能与目标条带对应的作用。
处理办法：在加热煮沸后，再添加适量的DTT或Beta，以补充不足的还原剂；或可加适量EDTA来阻止还原剂的氧化。
主要决定聚丙烯酰胺的价格还是聚丙烯酰胺的类型、聚丙烯酰胺成分以及聚丙烯酰胺的纯度。
1、阴离子聚丙烯酰胺按分子量高低来决定聚丙烯酰胺价格分子量越高价格越高。
2、阳离子聚丙烯酰胺按离子度高低来决定聚丙烯酰胺价格离子度越高价格越高。
3、非离子聚丙烯酰胺按分子量和水解度来决定聚丙烯酰胺价格高低分子量越大水解度越好的价格越高。
4、聚丙烯酰胺按分子量决定聚丙烯酰胺价格分子量越大价格越高。
目前国内生产阳离子型聚丙烯酰胺的技术，尤其是生产高分子量阳离子型聚丙烯酰胺的技术较为落后，研制，生产的主要是一些中低分子量阳离子型聚丙烯酰胺粉状产品，且产品结构单一，不能满足社会的需要，而高分子量阳离子型聚丙烯酰胺则主要依赖于国外进口。非离子型聚丙烯酰胺主要用于提高纸浆的滤性，增加干纸强度，提高纤维与填料的留着率。因此开发和生产高分子量阳离子聚丙烯酰胺，并应用于保护环境领域，具有特别重要的意义。
同时皮革加工过程中添加了多种化学***，在生产过程中还产生酸、碱、染料、硫化物、糖、油脂、蛋白质、毛纤维、皮屑、悬浮物等多种有机物和无机物阴离子聚丙烯酰胺是制革废水处理中常用的净水药剂，具有净水效果好、、性价比高、放心可靠等优点，在废水处理中占有重要的地位。一般来讲，不同离子型的聚丙烯酰胺的应用方法是存在着异常巨大的区别的。而且能有效去除80-95的悬浮物和90左右的胶体物质，对除去水中的***、病毒效果稳定。