无土栽培还可以避免土壤连作障碍。常规土壤栽培中，特别是在设施栽培中，多年栽培同一种作物，土壤中往往会积累大量离子、土传病害等对植株***的物质，造成土壤养分平衡，发生连作障碍。耗工费力的“客土”方法虽能够解决连作障碍，但生产成本过大。而无土栽培，特别是采用水培，则从根本上解决了此问题。无土栽培还能够从根本上杜绝土传病害。
无土栽培还能够从根本上杜绝土传病害。无土栽培使作物彻底脱离了土壤环境，因而也就摆脱了土地的约束。耕地被认为是有限的、宝贵的、又是不再生的自然资源，尤其对一些耕地缺乏的地区和***，无土栽培就更有特殊意义。无土栽培进入生产领域后，地球上许多沙漠、荒原或难以耕种的地区，都可采用无土栽培方法加以利用。以色列作为一个异常缺水的沙漠***，却有着好的园艺业，就是无土栽培和设施园艺大规模发展的结果。
无土栽培使农业生产摆脱了自然环境的制约，使其可以按照人的意志进行生产，所以是一种受控农业的生产方式。较大程度地按数量化指标进行耕作，有利于实现机械化、自动化，从而逐步走向工业化的生产方式。目前在奥地利、荷兰、美国、日本等国的花卉生产中都实现了无土栽培及工厂化育苗，整个花卉生产就是一条工业流水线，较大程度上实现了农业现代化。
