苦草有无性和有性两种繁殖方式。
1)无性繁殖
苦草冬芽的第2节间在春天形成一个或两个根状茎,并快速形成致密的丝状体幼芽,幼芽向上萌发绿叶;向下长出须状根形成苦草母株,又可再生出匍匐茎形成子株和根茎网络。) 有性繁殖苦草为雌雄异株,雄花小、量大,每株雄株产生花粉约47万粒, 一天内释放花粉两次;雌花花柄的高矮常与水深正相关,有利于遇到雄花受粉,完成受粉后花柄螺旋状收回,在水下发育成果实,在晚夏或早秋,部分果实释放种子。
研究发现苦草生物量及无性系分株数随水深梯度的增加显著降低,其株高随水深增加呈先升后降的趋势。顾燕飞等的试验表明,随着水深增加,苦草单位面积株数和匍匐茎数明显下降,但叶片长度、宽度、厚度、面积、匍匐茎长度、茎粗和块茎粗随水深显著增加。水深1.4~2.2 m的范围内,刺苦草有性繁殖体的生物量、有性繁殖体的收获系数和繁殖体个数都随水深的增加而减少;
藻类对苦草生长的影响:研究表明水网藻附着苦草叶片后导致叶片光响应能力显著下降。主要表现在:在水网藻主要附着的苦草叶片上部, 15 d后光系统 (PS) 的光化学效率显著降低;附着水网藻的叶片通过热的形式耗散掉的能量极显著增加, 有效荧光产量、光化学淬灭系数和相对光合电子传递速率、叶绿素A (Chl.a) 、类胡萝卜素 (Car) 和叶绿素a与叶绿素b之比 (Chl.a/Chl.b) 均显著降。