当长时间不使用电主轴时，需要做好保护，避免发生损坏。需要在主轴上装一刀柄，以保护卡刀的锥孔，主轴在没有装上刀柄的情况下是不允许转动的。
只有锥形的刀柄和具有良好动平衡特性的刀具才可以在高速转动下使用。不要使用被打孔的刀柄。
在安装时因为电主轴的轴承需要保持清洁，所以主轴的连接操作应在干净的环境中进行，否则轴承的寿命将显著减少。
新的或超过一个月未用的电主轴，刚开始工作时一定要作低速转动，好进行主轴预热空运转。锥孔内没有装入刀柄（或刀具）的状态下。主轴禁止运转。
为了长期保持主轴的获得上佳的加工效果，主轴高速运转时，只能使用动平衡达标刀具。进行切削时，好将主轴预热30分钟，使其达到热稳定状况。
一般来说，不同的电主轴限定选配刀具的规格尺寸也不同。此机床主轴使用刀具的小直径1毫米，大32毫米，刀长不宜超过100毫米。在切削条件优化的前提下，可以对以上参数作适当调整，但任何情况下主轴不要超负荷工作。
电主轴的冷却：机床目前一般采取强制循环油冷却的方式对电主轴的定子及主轴轴承进行冷却，即将经过油冷却装置的冷却油强制性地在主轴定子外和主轴轴承外循环，带走主轴高速旋转产生的热量。
机床另外，为了减少主轴轴承的发热，还必须对主轴轴承进行合理的润滑。
电主轴是近几年在数控机床领域出现的将机床主轴与主轴电机融为一体的新技术。高速数控机床主传动系统取消了带轮传动和齿轮传动。
电主轴修理：拆卸。使用工具主要有：内六角扳手、呆扳手、两脚活动扳手和主轴修架、主轴顶杆等专用工具。把待修电主轴放在专用主轴修架上，使用六角扳手卸下主轴前端盖和前主轴压盖和主轴后端盖。
用呆扳手固定转轴，用两角活动扳手从转轴上卸松后轴承左旋压 紧螺帽；使用主轴专用顶杆把转子连同后支承轴承和套筒等到组件从前往 后压出；从前轴承室卸下前轴承及隔环。
