微灌系统软件的管路在长期性应用后，为防止堵塞，应按时对其开展冲洗。微灌系统软件的管道冲洗应自上而下逐步开展，
支管和毛管应按轮灌组冲洗。管道冲洗的流程与规定是:
⑴
先要开启核心区总调压阀和待冲洗管路的闸阀，关掉别的闸阀，随后启动离心水泵，对管道开展冲洗，直至干管尾端出水清理才行。
⑵
先要开启一个轮灌组的各支管進口和末端阀门，关掉干管末端阀门，开展支管冲洗，直至支管尾端出水清理，再开启毛管尾端，关掉支管末端阀门冲洗毛管，直至毛管尾端出水清理才行，随后再开展下一个轮灌组的冲洗。
⑶
冲洗全过程中应随时随地查验管路状况，并搞好冲洗纪录。
微灌系统软件的管道冲洗工作进行后，应考运作，在试运转中观查管路的壁厚、管材、闸阀等处，如发觉渗漏、渗水、裂开、掉下来等状况，应妥善处理。 
滴灌没有达到预期的节水效果
毋庸质疑，国内各级***和用户采用滴灌的初衷就是看到这项技术具有显著的节水作用。文献报导与传统漫灌相比，滴灌可以省水50%-80%，一亩漫灌的耗水量能满足2-4亩滴灌用水。滴灌有效避免了输水过程损失和深层渗漏损失，减少了地面蒸发和径流损失,在北方特别是西北没有灌溉就没有农业的干旱地区，推广滴灌的意义不言而喻。
但是，水价低廉的现实淡化了基层的节水意识，加上管理不到位，该节约的水没有很好地节约下来，已建工程的滴灌节水率多数没有达到设计的节水效果，滴灌省水仅为50%左右，有的更低仅20-30%，其节水潜力值得挖掘。不少地方花大量资金建设滴灌工程项目，却没有看到预期的节水效果和成就，依然重复着水资源紧张的窘境。
喷嘴通常被设计为在一个较大的压力变化范围内工作，这就要求在喷嘴进口处保持正确的工作压力。如果喷头工作压力太高，则会造成雾化程度太高。雾化太高就会造成喷射半径的减少并且降低了喷洒均匀度，从而形成积水或喷洒不到位等现象，而且会造成水的浪费。为防止这种情况发生，有些生产商研制出可以被安装在喷嘴上或与喷头直接压铸一体的设备。如果用旋转喷头，太大的压力会引起喷头旋转太快。高速旋转的喷头射流如马尾，造成射程劲减。当然压力太小也会造成射程减少、喷洒不均匀等现象。