?工厂化无害化处理
如果有大型畜牧场和家禽场，因粪便较多，可采用工厂化无害化处理。主要是先把粪便收集集中，然后进行脱水，使水分含量达到20%～30%。然后把脱过水的粪便输送到一个专门蒸汽消毒房内，蒸汽消毒房的温度不能太高，一般为80～100摄氏度。温度太高易使养分分解损失。肥料在消毒房内不断运转，经20～30分钟消毒，全部的虫卵、杂草种子及***的病菌等。消毒房内装有脱臭塔除臭，臭气通过塔内排出。然后将脱臭和消毒的粪便，配上必要的天然矿物，如磷矿粉、白云石和云母粉等，进行造粒，再烘干，即成有机肥料。其工艺流程如下：粪便集中～脱水～消毒～除臭～配方搅拌～造粒～烘干～过筛～包装～入库。总之，通过有机肥的无害化处理，可以达到降解有机污染物和生物污染的目的。
生物有机肥堆肥大小有什么讲究吗？
有的，需要注意平衡；一个是微生物有机肥发酵菌堆肥的大小。微生物有机肥发酵菌堆肥如果太小堆，热量就容易散失，堆肥就不易发热；微生物有机肥发酵菌堆肥如果太大堆，空气就不容易渗透到里面去，就会产生上述空气不足的问题。另一个是微生物有机肥发酵菌堆肥材料的颗粒大小，如果颗粒太大，那表面积就相对较小，分解的速度会比较慢；如果颗粒太小，空气就不容易进入，一样会有上述空气不足的问题。
生物菌肥
施用生物菌肥，增加土壤生物菌量，活化土壤，增加土壤养分的利用效果。生物菌肥可在植物微生物代谢循环中起催化作用，能促进土壤团粒结构的形成，改善土壤内部空隙空间，增加土壤生物活性，增强性养分的释放，有利于根系生长，提高植物的抗逆性。生物菌肥与有机肥配合使用效果好，有机肥提供有机质，生物肥提供有益微生物，另外有机质是微生物的食物，土壤中有机质越多微生物才能活的更好!
1、优点是可以改善土壤中的一些固定的营养元素，刺激根部的生长和吸收，也可以减少相应营养元素的施肥量。
2、缺点是它没有任何的营养元素，它也不能长时间的提供农作物的营养元素。由于菌肥是由活菌结构成的，通常它是忌阳光直射的也不能和药混施，对土壤温度、湿度、酸碱度、有机质含量等环境条件的要求亦较为严格。
适宜搭配，选择优
有机物为有益微生物提供大量食物，有益微生物促进有机肥的腐殖，二者搭配施肥，相互促进，取长补短，相互利用，可以改良疏松土壤，提高土壤的透气性、保水性，增强根系的吸收能力，提高肥料利用率，从而降低化肥的施用量。
随着有机物的增加，作物的抗逆能力也随之增强，同时把土壤中残留下来的无效磷、无效钾变为有效磷和有效钾，供作物吸收利用，这样可减少化学肥的用量，提高肥效，降低成本。
由此可见，生物菌肥与化肥和有机肥、配合施用效果好!但要想达到佳的施肥效果，但是配合施用时就应注意以下几个问题。