包装物的无菌处理。目前用于无菌灌装瓶子的杀菌方法有：喷淋法、喷雾法和灌注法。由于国内厂家较难将瓶子的初始染菌程度控制到较低的指标，所以选用杀菌可靠性较高的灌注法对瓶子内部进行灭菌处理，瓶身外部采取喷淋法冲洗杀菌，并在杀菌保持时间上留有充分的余地，可以确保达到商业灭菌要求。
目前用于无菌灌装的盖子杀菌方法有：喷冲法、喷雾法和紫外线照射法。
据了解，灌装机生产线的应用可以实现食品、制药、日化企业的高量生产，进而帮助生产企业实现高速生产的目的。我国灌装设备基本是在引进设备和技术的基础上发展起来的。八十年代，引进各种饮料灌装生产线300多条，包括啤酒灌装线达500多条。近年来，饮料工业发展迅猛，碳酸饮料、果汁饮料、蔬菜汁饮料、含乳饮料、瓶装饮用水、茶饮料等品种不断丰富，产量上的"飘红"使得对设备市场的需求也呈"牛市"。
当饮料灌装机通过使用前检查无碍后，即可进行使用，使用中需要注意安全设备功能是否正常。在每次关机后重开前，需要检查水箱、链板、传送带、储盖箱等是否有异常，同时要注意水源、电源、气源是否接通，在检查设备无碍后，再合上主电源QF，电源指示灯亮起，故障指示灯、急停指示灯不亮才可以按动操作控制箱上的启动按钮和灌装处启动开关，开始机器的整体运作，要停止机器运作，需要在灌装处和控制箱处按停止按钮，停机后应关掉主电源。
灌装采用重力灌装方式。灌装阀打开后物料通过灌装阀完成灌装过程，灌装结束后瓶口下降离开灌装阀，瓶子通过卡瓶颈过渡拨轮进入旋盖机。旋盖机上的止旋刀卡住瓶颈部位，保持瓶子直立并防止旋转。旋盖头在旋盖机上保持公转并自转，在凸轮作用下实现抓盖、套盖、旋盖、脱盖动作，完成整个封盖过程。成品瓶通过出瓶拨轮从旋盖机传送到出瓶输送链上，由输送链传送出三合一机。