为防止洁净室外未净化空气渗入室内，同时也为了防止洁净室内的洁净空气向外渗漏，造成能量的浪费，甚至影响室内的洁净度。给排水管道穿过洁净室墙壁、楼板和顶棚时，应设套管，套管内管段不得有接头，管道和套管之间必须用不起尘的密封材料封闭。目前净化工程行业涉及如下：食品行业：奶制品、果汁、盐类、酿酒厂、肉类加工、烘焙面包房、槟榔厂、海鲜、调料包等。
洁净厂房管道的内外壁应尽量光洁，管道及管件的接头处应有较好的平整度，以保证水流有较好的水力性能，以及降低微粒的沉积和微生物的繁殖。净化工程行业涉及如下：微电子、日用化妆品、印刷包装、光学光电、化学、生物制药、***器械、洁净***室、航空航天、涂装涂料、古董库房。目前净化工程行业涉及如下：***器械：***设备、***室；涂装涂料：纳米功能涂料、建筑涂料涂装、喷涂车间、家具烤漆房。
为保证生产水质不被其它给水系统污染，洁净厂房内的给水系统按照生产、生活、消防等用途不同，应分别设置。洁净厂房内的生产用水系统可按生产线的数量，分别布置，建议每条生产线给水系统的起端均设置检修阀门及计量水表，以便检修和成本核算。目前净化工程行业涉及如下：食品行业：奶制品、果汁、盐类、酿酒厂、肉类加工、烘焙面包房、槟榔厂、海鲜、调料包等。
