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当设置性负压隔离病房时，因它的建筑围护结构密闭，它的气流都是在控制下，不允许有自然通风的可能。要创造一个舒适的环境，就必须设置空调系统。鉴于这类病房要控制的是空气中致命性的病原体，目前空调机对回风的空气处理不能保证100％阻隔或病菌，所以要求采用全新风直流式空调系统。参照美国CDC规范，性(负压)隔离病房需要12次/h换气，这也是密闭房间空调系统达到舒适的温湿度应该达到的风量，所以建议用此通风量。
负压病房空调设计
从空调设计来看，整个层面可分为非净化区（包括生活区及设备间等）与净化区（包括病房与办公辅房等），净化区又分为病房负压区域与办公正压区域。通过设置办公正压区域，对病房负压区域形成一种包围，能有效阻止污染空气向外传播。空气隔离的是压差控制，通过合理的平面设计，在相邻的不间建立压差，能有效阻止气体从污染区流向半污染区。在工作区内，护士、医生办公室等区域是梯度的层，而病室卫生间是梯度层。
负压隔离病房快速交付使用
1.装饰***：房间设计成统一的标准尺寸，将墙板、顶面做成固定尺寸模数，门、窗等均按标准化尺寸设计，地面选用厂家有库存的产品系统，实现快速生产、快速安装的方式。
2.暖通***：新、排机组选型以及自动控制系统方案等在设计时跟设备供应商进行技术方案沟通，请厂家同步提供配套产品的生产，实现尽快供货；风管系统尽量采用几个标准的风管型号，实现机械化加工制作，现场快速吊装；排风支管采用成品PVC圆管连接，节省人工。
3.电气***：顶面电线全部走桥架，墙面电线走PVC管，实现快速安装方式。
