南海表层盐度的分布，近岸和外海的区域差异很明显。近岸海域大多受低盐沿岸水的影响，盐度较低，季节变化较大。例如珠江口附近盐度等值线的分布，就与珠江冲淡水的扩展方向休戚相关：夏季低盐水舌由偏南向逐渐转东，秋、冬季则由偏东向渐次转南和西南，洪水年份盐度低至7.0以下。外海深水区表层盐度的分布，则为季风环流所左右：冬季，来自太平洋的高盐水舌，界标，经巴士海峡一直向西南伸展；南海中部因东侧补偿流北上，低盐水舌则向东北伸展；夏季，西南季风漂流可使南部的低盐水舌向东北扩展，而把海区北部的高盐水挤向北方。
海洋局办公室在《关于印发〈2013年海洋环境监测工作任务〉的通知》上，对沿海各省（自治区、直辖市）及计划单列市海洋厅（局），海洋局北海、东海、南海分局，国海洋环境监测中心，海洋技术中心，海洋局海洋研究所、第三海洋研究所提出要求：要进一步推进实时在线监测工作，建立在线监测技术体系，创新和集成海洋环境监测技术，优化现有监测技术，水库界标，充分挖掘在线监测技术潜力，实现多种技术手段的运用，提高监测工作效能；要进一步强化质量管理和质量控制工作，生产界标，建立健全质量管理制度和质量责任追究制度，完善质量控制技术手段，切实保障
监测数据信息质量。在波浪数学模型研究方面，可应用BI—CGSTAB法求解由椭圆型缓坡方程离散得到的代数方程组，以提高求解效率。从水波发展方程出发，可导出一种用于大区域波浪变形问题的数学模型。通过引入弱非线性波色散关系，可使双曲型缓坡方程能够有效地考虑波浪的非线性效应。对高阶Boussinesq方程的进一步研究，可使方程的色激性从入水到深水都达到很高精度，并提高方程的非线性精度，可以更精准的计算较深水域波浪的非线性特征。
针对带自由表面的波浪场问题，通过把能有效模拟自由面形态的N— S方程和波能平衡方程的结合，可导出一个能考虑破波能量损失的抛物型缓坡疗程，用这个方程可模拟规则波和不规则波破碎引起的波高变化。建立沿岸流数学模型，可模拟海岸上波高变化和破碎波波高、波浪增减水和沿岸流。
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