microRNA和piRNA研究
AGO蛋白家族
AGO蛋白家族是指与以小分子RNA(***all RNA)为介质的遗传***发现控制机构有关的蛋白质群。基于氨基酸序列的相似性,AGO蛋白家族又分为AGO亚族与PIWI亚族,已发现在生殖细胞、***(ES、iPS等)中有表达。
和光纯药公司推出了众多用于对miRNA和mRNA (存在于细胞和***中的RISC的组成成分)进行功能分析的工具,这些工具不仅适用于对miRNA的分析,同时也适用于对靶标mRNA的分析。
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AGO蛋白家族 |
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AGO亚族 |
PIWI亚族 |
人 |
AGO1, AGO2, AGO3, AGO4 |
PIWIL1 / HIWI, PIWIL2 / HILI, PIWIL3, PIWIL4 / HIWI2 |
鼠 |
AGO1, AGO2, AGO3, AGO4 |
PIWIL1 / MIWI, PIWIL2 / MILI, PIWIL4 / MIWI2 |
RNA结合蛋白 |
microRNA、siRNA等 |
piRNA等 |
1. microRNA研究
microRNA(简称miRNA)是一种长约22个nt(核苷酸)的内源性RNA分子,通过与靶标mRNA的互补配对,可***mRNA的裂解和翻译,从而在动植物体内发挥重要的调控作用。据推测,在***和鼠体内存在上千种miRNA,因此对于miRNA的各种研究(例如对功能不明的新型miRNA的鉴定以及对与特定***相关的miRNA功能的说明等)迅速发展成为一大研究领域。近来,***中存在miRNA这一重大事实的发现,开创了利用miRNA作为生物标志物进行包括***症在内的******的***未来。一般认为,microRNA发挥作用的方式如下:先在细胞中经过多个阶段发育成熟,再与蛋白质结合生成蛋白质复合物“RISC”(“RNA诱导沉默复合物”),然后与RISC主要组成部分AGO亚族蛋白结合,***后再与靶标mRNA结合,从而达到降解mRNA链或***翻译的目的。
***中存在4种AGO亚族蛋白(hAgo1~hAgo4),可泛表达***信息,但表达水平因类型而异。在AGO亚族蛋白中,只有AGO2具备对靶标RNA裂解的切割酶活性,因此是一种***具表达水平的蛋白质,可在miRNA合成途径中发挥至关重要的作用。由于RISC能够与AGO蛋白***发生***沉淀,因此可从RISC沉淀物中回收miRNA;而且进一步研究表明,靶标miRNA为共沉淀剂,因此***沉淀成法为研究miRNA功能的基本方法。
鉴于上述情况,和光纯药特别推出了众多对miRNA功能进行分析的工具,其中主要为利用抗AGO***的miRNA研究工具。通过组合使用上述工具,即可实现对miRNA和mRNA(存在于细胞和***中的RISC的组成成分)的综合分析—miRNA分析和靶标mRNA分析。
1)microRNA纯化***盒系列:
一种基于利用AGO蛋白***的***沉淀方法
特性:
1)适用于内源性AGO蛋白的***沉淀法
2)miRNA与AGO蛋白结合的纯化性能高
3)其他RNA(如rRNA(核糖体)和RNA的降解片段)的污染度低
4)适用于microRNA的******以及纯化microRNA成分的微阵列技术(测定***表达谱的方法和技术)
microRNA提取***盒,人/鼠AGO1(10次反应;和光.:291-70201)
microRNA提取***盒,人AGO2(10次反应;和光.:292-66701)
microRNA提取***盒,鼠AGO2(10次反应;和光.:292-67301)
microRNA提取***盒,人AGO3(10次反应;和光.:297-70301)
(2)cDNA编码microRNA***盒的制备
和光纯药microRNA******盒可以用于制备cDNA编码microRNA,只需在microRNA片段制备后的1.5日之内即可完成***过程。该***盒中含有从虾中提取的碱性磷酸酶(SAP),能与其中的耐热性单链DNA连接酶(另售)和原改良接头发生连接反应。与传统方法(利用从***中提取的碱性磷酸酶和T4 RNA连接酶)相比,***效率显著提高。
特点:
1)耐热性连接酶能够实现接头的准确连接,从而提高***效率
2)适用于microRNA***以形成二级结构
3)操作简单,只需在1.5日之内即可生成cDNA编码microRNA
和光microRNA******盒(8次反应;和光.:290-66501)
接头连接***、准确、简捷
耐热性单链DNA连接酶重组体解决方案(200个单位(和光.:298-65103);500个单位(和光.:292-65101)
和光靶标mRNA******盒(10次反应;和光.:298-68001)
和光纯药生产的靶标mRNA******盒用于借助微量mRNA实现cDNA扩增,尤其是利用AGO IP RNA片段实现microRNA靶标mRNA***。扩增后的cDNA将成为microRNA的靶标mRNA。
特点:
1)方法简易
2)具备实现微量mRNA扩增的性能
3)cDNA扩增方式不依赖于mRNA的长度
4)适用于microRNA靶标mRNA的研究
和光PCR纯化***盒(30次反应(和光.:298-67901)
和光纯药生产的PCR纯化***盒,用于在利用RT-PCR或PCR完成DNA合成后的仅10分钟内去除在各种分子生物学试验反应缓冲液中形成的引物、引物二聚体、dNTP(三磷酸脱氧核苷酸)以及诸如DNA聚合酶、限制性内切酶等多种酶。
THUNDER Taq Gold DNA聚合酶(不含镁离子的缓冲液)
(250个单位;和光.:317-07081):PCR(聚合酶链式反应)用耐热性DNA聚合酶
建议采用THUNDER Taq Gold DNA聚合酶(不含镁离子的缓冲液)来***非特异性扩增。THUNDER Taq Gold DNA聚合酶用于PCR的热启动,在进入PCR循环前,在95℃的温度下经过10分钟的热处理后被活化。由于利用THUNDER Taq Gold DNA聚合酶(不含镁离子的缓冲液)方式实现扩增后的DNA片段是一种腺***呤的3'末端,因此能够直接插入到T载体中。
(3)***
AGO1***、单******(1F2)
(50μL(和光.:018-22401))〈用于蛋白质印迹法〉
AGO1***、单******(2A7)
(50μL(和光.:015-22411))〈用于***沉淀法〉
抗人AGO2***、单******(4G8)
(50μL(和光.:011-22033);100μL(和光.:015-22031)
〈用于蛋白质印迹法、***沉淀法以及***细胞化学染色法〉
抗小鼠AGO2***、单******(2D4)
(50μL(和光.:014-22023);100μL(和光.:018-22021)
〈用于蛋白质印迹法、***沉淀法以及***细胞化学染色法〉
抗人AGO3***、单******(1C12)
(50μL(和光.:018-23241))〈用于***沉淀法〉
2. piRNA研究
PIWIL1***、单******(2C12)
(100 μL (和光.:017-23451))〈用于***沉淀法〉
特点:
1) 可***沉淀内在性PIWIL1蛋白质。(5~10?g浓度为10%的蛋白G微珠)
2) 可***沉淀PIWI1结合piRNA。
3) 可在人、鼠的***和细胞中使用。
使用例:
- 小鼠***中内源性PIWIL1的***沉淀(IP)-1

Lane 1: NEC14 cells, mouse IgG IP分级(1/2 vol.)
Lane 2: NEC14 cells, 2C12 IP分级(1/2 vol.)
Lane 3:小鼠***IgG IP分级(1/2 vol.)
Lane 4:小鼠***, 2C12 IP分级(1/2 vol.)
Cell number: 1 x 107 cells
***(小鼠***)重量25mg
******(蛋白质印迹)
Anti PIWIL1 polyclonal antibody(gifted from Dr. Miyagawa, Osaka Univ.)
This antibody is not ***ailable from Wako.
- 小鼠***中内源性PIWIL1的***沉淀(IP)-2

Lane M:分子量Marker
Lane 1:小鼠IgG IP分级(1/2 vol.)
Lane 2: 2C12 IP分级(1/2 vol.)
***(小鼠***)重量25mg
******(蛋白质印迹)
Anti PIWIL1 polyclonal antibody
(gifted from Dr. Miyagawa, Osaka Univ.)
This antibody is not ***ailable from Wako.
lane M:分子量Marker

Lane 1:小鼠IgG IP RNA 分级(1/2 vol.)
Lane 2: 2C12 IP RNA 分级(1/2 vol.)
***(小鼠***)重量25mg
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