柴油滤清器的结构大致与机油滤清器相同，有可换式和旋装式两种。但其承受的工作压力和耐油温要求较机油滤清器低得多，而其过滤效率的要求却比机油滤清器高得多。柴油滤清器的滤芯多采用滤纸，也有采用毛毡或高分子材料的。柴油滤清器除过滤柴油中的机械杂质外，还有一个重要的功能就是滤水。水的存在对于柴油机供油系统危害极大，锈蚀、磨损、损伤汽缸活塞环甚至会产生拉缸现象还能够恶化柴油的燃烧过程。柴油滤清系统根据液体密度的不同通过流体流向控制技术，对水分进行分离达到过滤水分的效果。
油水分离器就是将油和水分离开来的仪器，机理上主要分为油中除水分离器和水中除油分离器；从用途上主要分为工业级油水分离器、商用油水分离器和家庭油水分离器几种；从分离原理上分有膜过滤油水分离器、选用亲油性材料的油水分离器、比重不同分层的无动力油水分离器、药理作用的破乳油水分离器；油水分离器主要应用在石化工业、汽车工业、污水处理工业等。
汽车用油水分离器是燃油滤清器的一种，主要的作用就是除去柴油中的水分，以降低喷油嘴故障，延长发动机的使用寿命。原理主要是根据水和燃油的密度差，利用重力沉降原理去除杂质和水份的分离器，内部还有扩散锥，滤网等分离元件。油水分离器还有别的功能，如对燃油进行预加热防止结蜡，过滤杂质等。
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