由于空调冷却水系统的结垢、腐蚀和藻类滋生不是在短期内形成的，也不会在短期内对系统有***性的影响，所以，往往得不到运行管理人员足够的重视。另外，由于空调冷却水系统比较简单，设计人员对其重视不够，并且，冷却水的处理是给排水***和暖通***均相关的***，而冷却水系统多是由暖通***人员搞，所以，难免造成先天设计不尽合理。在设计过程中针对空调冷却水系统易结垢腐蚀和菌藻滋生的特点，其处理方法也与冷冻水系统有所不同。冷却水的处理方法可分为化学法和物理法。
化学法：
目前，大型冷却水系统多采用化学方法，为此必须在冷却水中加入阻垢剂、缓蚀剂、杀菌灭藻剂及其配套的清洗剂等，从而形成了冷却水的***水处理技术。可供设计大型空调冷却水处理的参考。由于阻垢可保证传热效果（节能），级蚀剂、杀菌灭藻剂可减少设备腐蚀，延长设备寿命均属正效益，所以被世人所关注，国外各大水处理公司都把此技术作为******来抓，据报道1987年工业水处理剂（冷却水部分）销誉值为5.86亿美元，年初1992年销售值为7.65亿美元，年增长率为6.近几年来，随着我国国民经济的快速发展，对水处理剂的研究和开发也有了长足的发展。
加药处理法：
该方法较早应用于热水锅炉和船泊水处理，近几年来，该方法也被用于冷却水系统，常用的药剂多为固态晶体硅酸盐被膜缓蚀剂。实践证明，有以下几点需要注意：不同的被膜剂要求有不同的溶解温度，对于把加药灌设在循环水系统上的，水温往往能达到溶解温度，而对于把加药灌设在补水系统上的，应特别注意防止水温过低，如果水温过低，被膜缓蚀剂的溶解不好，就会影响缓蚀的作用。
物理方法：
是近几年开始普遍广泛使用的一种方式，该方法运行费用低、使用方便、易于控制、无污染是一种比较理想的水处理方法，实际上国外早在60年代便把注意力由化学方法转移到物理方法的开发上来。目前，应用的物理方法有磁力法、电解法、超声法、静电法等。
电解法能***水垢的附着，但是除垢不彻底，且具有电解孔蚀的***；早期应用的磁力法稳定性比较差，长时间使用不能控制积垢，必须定期清扫集聚在控制器中的氧化铁；而静电法则克服了上述诸放法的缺点，并且，除了防垢和溶垢外，还有显著的杀菌灭藻的效能。但是静电法和电子水处理法缓蚀作用较专用的化学缓蚀略低，在一般空调冷却水系统内可不考虑采用其他缓蚀放法。而在一些对缓蚀要求较高的系统***好同时适量添加一些缓蚀剂，可获得更好效果。