理论上Co、Ni主要以类质同象的形式存在于黄铁矿中，且呈Co3 或Ni4 价态。As、Sb是使黄铁矿产生空穴心的主要晶格杂质，黄铁矿价格，由于其原子半径较大，在黄铁矿晶格中的间隙位置很难存在，只能以类质同象代替硫的形式存在于黄铁矿的晶格中。从Cu、Pb、Zn的原子结构及成键特点来看，黄铁矿矿石，Cu2 不能形成d2sp3杂化键，而是形成d2sp3杂化，所以Cu2 进入黄铁矿晶格中Fe2 位置时，结果将产生畸变，因此Cu2 类质同象代替Fe2 很难发生，而Pb、Zn进入黄铁矿晶格代替Fe2 将更难。黄铁矿中的Cu、Pb、Zn的存在将消耗一定数量的S、As等阴离子，造成黄铁矿晶格中硫的空位或As、Sb等杂质类质同象代替硫的数量减少，从而有利于电子心型黄铁矿的形成。
黄铁矿常见完好的晶型，呈立方体{100}（首图左上1），五角十二面体{210}（首图上，中间）、八面体{111}（首图上，黄铁矿，右1）。在立方体晶面上常能见到3组相互垂直的晶面条纹，这种条纹的方向在两相邻晶面上相互垂直，和所属对称型相符合。此外还可以形成穿插双晶，集合体呈致密块状、分散粒状、核状等。（核状黄铁矿常被不良商家当做陨石）
铁矿是半导体矿物，由于不等价杂质组分代替，如Co3 、Ni3 代替Fe2 或[As]3 。[AsS]3 代替[S]2-时，产生电子（n型）或空穴（p型）而拥有导电性。黄铁矿半导体类型与主要杂质赋存状态关系密切，黄铁矿生产，黄铁矿电子心和空穴心特征与杂质元素的分布特征有直接关系。针对影响黄铁矿心型的主要杂质元素来说，Co、Ni是使黄铁矿产生电子心的主要杂质成分，As、Sb是使黄铁矿产生空穴心的主要杂质成分。Co、Ni进入黄铁矿晶格，只可能以两种方式存在，要么以类质同象方式占据黄铁矿经各中Fe2 的位置，要么位于黄铁矿晶格中的间隙位置。
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