在种苗生产过程中的工作是水分管理。但是在实际工作过程中却常常由经验不多的人来做。在不恰当的时间或者用错误的方式浇水，会严重影响穴盘苗的生产。
不允许穴盘苗完全干燥；反之，基质中水分过于饱和也不行，会造成根系缺氧（0-2%）
穴盘苗生产水分管理一般以子叶展开为分界线。
育苗盘
苗期管理。移苗补缺：出苗后要及时将苗床上覆盖的地膜揭去，西红柿育苗盘，防止揭膜过迟而形成“高脚苗”。待子叶展开后就要立即进行间苗和移苗补缺，缺苗移补好后，立即对苗床喷洒清水。水分管理：穴盘内育苗的基质容量小，空隙度大，可吸纳的水分较少，苗床对幼苗供水的缓冲性小，易产生失水现象，夏秋高温季节要在清晨和傍晚气候凉爽时及时喷洒水分。
节能省工省力、。穴盘育苗采用精量播种，一次成苗，从基质混拌、装盘、播种、覆盖等一系 列作业实现了自动控制
穴盘育苗苗期管理。移苗补缺：出苗后要及时将苗床上覆盖的地膜揭去，防止揭膜过迟而形成“高脚苗”。待子叶展开后就要立即进行间苗和移苗补缺，将单多余的苗拔起移入缺苗的空，
节能省工省力、。穴盘育苗采用精量播种，一次成苗，从基质混拌、装盘、播种、覆盖等一系 列作业实现了自动控制，育苗盘，苗龄比常规苗缩短10—20天
穴盘育苗采用工厂化化生产方式育苗，有利于推广优良品种
育苗基质具有比重轻、保水能力强、根坨不易散等特点，缓苗快，成活率高。穴盘育苗还可配备机械化移栽。
穴盘苗便于存放，运输。
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