与其他芯片制作技术相比较，微珠芯片具有如下优势:
(1) 密度高微珠芯片的点样密度是原位光合成法的16倍，喷点法的100倍，接触式点样的400倍。
(2)测试重复性好鉴 于超高密度的特点，微珠芯片中每个样品都能保证约30个重复，从而保证测试的高重复性、高重复串以及高可靠性。
(3)定制方便若需要在已完成的芯片中增加测试点或新***，只要合成相应的微珠加入到微珠混合池中即可。
(四)***芯片数据分析
***芯片分析包括五个基本步骤:生物学问题、样品制备、生***学反应、检测、数据模型分析。***芯片数据分析包括两部分，表面氨基修饰的微塑料，数据可靠性分析和生物学意义分析。
原位合成法主要为光引导聚合技术，广东表面氨基修饰，它不仅可用于寡聚核苷酸的合成，也可用于合成寡肽分子。光引导聚合技术是照相平板印刷技术（ photolithography ）与传统的核酸、多肽固相合成技术相结合的产物。半导体技术中曾使用照相平板技术法在半导体硅片上制作微型电子线路。固相合成技术是当前多肽、核酸人工合成中普遍使用的方法，技术成熟且已实现自动化。二者的结合为合成高密度核酸探针及短肽阵列提供了一条快捷的途径。
***芯片又称为DNA微阵列(DNA microarray)，可分为三种主要类型：1）固定在聚合物基片（尼龙膜，纤维膜等）表面上的核酸探针或cDNA片段，通常用同位素标记的靶***与其杂交，玻璃表面氨基修饰，通过显影技术进行检测。这种方法的优点是所需检测设备与目前分子生物学所用的显影技术相一致，相对比较成熟。但芯片上探针密度不高，样品和***的需求量大，定量检测存在较多问题。
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