在骨成像及定量分析方面的应用
显微CT成像对骨质疏松症的研究尤为重要，特别是***进展和治LX果，MicroCT检测BMD，因为它是少数能够提供骨矿物质含量和密度信息的成像技术之一。通过高分辨率的显微CT测量这些变化，有助于开发ZL剂并理解控制这些过程的分子机制。
在环境科学的应用
鱼耳石是鱼的生命过程和环境相互作用的产物，记载了生长过程的大量环境信息，可客观记录水体环境的历史变迁及低浓度污染物的富集。
显微CT有2 种基本结构：（1）样品静止，X射线球管和探测器运动：这种结构和临床螺旋CT一致， 球管绕样品旋转。扫描速度快，射线剂量小，空间分辨率较低，多用于动物扫描。（2）样品运动，X射线球管和探测器固定：样品在球管和探测器之间自旋，并可做上下和前后移动。扫描速度较慢，射线剂量大，MicroCT数据分析，空间分辨率高，多用于离体标本扫描。
好比一张摄影的照片，人为得可以分割成许多小方块。如果照片本身很清晰，那么分割得越小，放大同样倍数后，看到的细节也会越多；但是如果照片本身不是很清晰的，分割得再小，放大后也是看不清细节的。分割的大小对应重建尺寸，MicroCT，而图像本身是否清楚对应的是图像分辨率。
前面提到，空间分辨率受系统几何参数的影响，决定了影像的清晰度。
为证实真实的空间分辨率，某些公司专为评估显微CT系统的空间分辨率而设计了一种模体作为扫描和重建的对象。它含有处于正交取向的两个完全相同的硅芯片，各自带有若干不同粗细的校准线和图案。扫描和重建这样一个模体可证明真实的空间分辨率。
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