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NEAR相关酶
切口酶扩增反应(Nicking Enzyme Amplification Reaction, NEAR)是一种基于切刻内切酶切割特性的恒温扩增方法,详细原理可参考啥黑科技可10分钟完成核酸分子检测?。其使用的酶有两种:切刻内切酶:如Nt.BstNBI切刻内切酶,WLB8201KIT***盒代理商,该类酶不同于常规限制性内切酶,其识别特定序列后仅在DNA其中一条链上切割形成缺口,并暴露出游离的3’端;DNA聚合酶:如Vent (exo-) DNA聚合酶或Bst DNA聚合酶,荧光型WLB8201KIT***盒代理商,用于DNA链合成,同时具有链置换功能。
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重组酶聚合酶扩增技术(Recombinase Polymerase Amplification,MIRAWLB8201KIT***盒代理商, RPA)是一种多酶协作的反应体系,详细原理可参考充满想象力的恒温扩增技术:RPA、RCA、SDA、HDA。该体系反应酶包含三种:重组酶:可与引物结合形成复合体,***至与引物同源的靶序列,促使引物与模板结合,同时帮助DNA解链,以便启动扩增;单链DNA结合蛋白:可与被置换出的DNA单链结合,稳定单链结构;DNA聚合酶:如Bsu DNA聚合酶,用于DNA链合成,同时具有链置换功能。对于RNA模板,需在反应中加入逆转录酶形成RT-RPA体系;若利用标记探针进行检测,还需加入核酸酶对探针序列进行切割,常用核酸酶有核酸内切酶 IV(Endonuclease IV, nfo)和核酸外切酶 III(Exonuclease III, exo),RAAWLB8201KIT***盒代理商,或者可与CRISPS/Cas系统搭配使用。
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逆转录酶逆转录酶又称反转录酶,是一种RNA介导的DNA聚合酶,其反应过程中体现出三种功能为:以RNA作为模板合成互补DNA链 (complementary DNA, cDNA),形成RNA:cDNA杂交链;发挥RNase H活性,降解RNA:DNA杂交链中的RNA模板;以cDNA作为模板合成第二链DNA,形成双链DNA(如下图)。其中,RNaseH活性是逆转录酶的一个内在特性,可在合成过程中同时切割RNA:cDNA杂合链中的RNA模板,该特性可能降低逆转录效率,因此在实际应用中,常采用人工改造后的低或无RNase H活性的逆转录酶。常用的逆转录酶有AMV和M-MLV,AMV分离自禽类成髓细胞瘤病毒(***ian Myeloblastosis Virus, AMV),M-MLV逆转录酶分离自莫洛尼氏鼠病毒(Moloney Murine Leukemia Virus, MMLV),前者热稳定性优于后者,但AMV逆转录酶的RNaseH活性也更强,不利于长片段cDNA合成。市面上多使用经***工程改造过的M-MLV逆转录酶,其热稳定性改进,可在50℃左右工作,同时RNase H活性进一步减弱,提高了其逆转录效率。
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