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NEAR相关酶
切口酶扩增反应(Nicking Enzyme Amplification Reaction, NEAR)是一种基于切刻内切酶切割特性的恒温扩增方法,详细原理可参考啥黑科技可10分钟完成核酸分子检测?。其使用的酶有两种:切刻内切酶:如Nt.BstNBI切刻内切酶,该类酶不同于常规限制性内切酶,其识别特定序列后仅在DNA其中一条链上切割形成缺口,荧光型恒温扩增***盒,并暴露出游离的3’端;DNA聚合酶:如Vent (exo-) DNA聚合酶或Bst DNA聚合酶,用于DNA链合成,同时具有链置换功能。
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尿DNA糖基化酶尿DNA糖基化酶(UDG酶)又称尿-N-糖基化酶(UNG酶),荧光型恒温扩增***盒报价,可水解含尿的单链和双链DNA释放出游离尿,而对RNA无活性,与dUTP搭配使用,可建立成PCR防污染体系。其原理如下:在PCR体系中将dTTP部分或全部替换为dUTP后,使得反应生成含有dU碱基的扩增产物,这些扩增产物不同于天然模板,在进入含有UDG酶的反应体系时,可被UDG酶识别并切割尿碱基与糖磷酸骨架间的N-糖基键,而经切割后的DNA链在碱性或高温条件下易于断裂降解,从而失去被当作模板再扩增的能力,因此可防止扩增子污染(如下图)。市面上的UDG酶主要有普通型和热敏型,其中热敏型UDG酶在室温条件下即可催化反应,50℃以上加热可使其灭活,防止其降解后续PCR形成的含dU扩增产物。虽然UDG/dUTP体系具有防污染功能,但在实际测试中还得兼顾PCR的效率和灵敏度。一方面需确保PCR扩增产物掺入足够量的尿碱基,从而可被UDG有效切割;另一方面也需要保证反应体系添加的dUTP不会明显影响PCR效率,因此dTTP和dUTP的佳比例需通过优化确定。
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RPA相关酶
重组酶聚合酶扩增技术(Recombinase Polymerase Amplification, RPA)是一种多酶协作的反应体系,详细原理可参考充满想象力的恒温扩增技术:RPA、RCA、SDA、HDA。该体系反应酶包含三种:重组酶:可与引物结合形成复合体,荧光型恒温扩增***盒公司,***至与引物同源的靶序列,促使引物与模板结合,同时帮助DNA解链,以便启动扩增;单链DNA结合蛋白:可与被置换出的DNA单链结合,稳定单链结构;DNA聚合酶:如Bsu DNA聚合酶,用于DNA链合成,同时具有链置换功能。对于RNA模板,需在反应中加入逆转录酶形成RT-RPA体系;若利用标记探针进行检测,荧光型恒温扩增***盒哪家好,还需加入核酸酶对探针序列进行切割,常用核酸酶有核酸内切酶 IV(Endonuclease IV, nfo)和核酸外切酶 III(Exonuclease III, exo),或者可与CRISPS/Cas系统搭配使用。
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