巴氏杀菌早用于牛乳消毒，以杀灭主要对象菌——为目标，并温下保存期限的要求。经巴氏杀菌后的产品，因其中尚存在有非致病的芽孢菌，在常温下可能繁殖，因而只有有限的货架寿命。若要储藏，则还需要与其他保藏手段相结合，如冷藏、发酵、加入添加剂（、糖、防腐剂及低水分活度物质）、包装、脱氧剂等。市售无菌乳在2~4℃下保存，即为常见的例证。
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巴氏杀菌的代替方式：
电解杀菌：在导电的溶液中，含乳饮料低温巴氏杀菌流水线厂商，由于在电极和溶液界面上交换电子而引起的氧化还原反应，玉米低温巴氏杀菌流水线厂商，这种技术的反应分为两种，一种是在外界电能的作用下发生的，一种是没有外接电源而是靠外界的光能、热能或者其他形式的能量激发而成。
激光杀菌：激光是电磁波，含乳饮料低温巴氏杀菌流水线厂商，也是一种能量流，北京低温巴氏杀菌流水线厂商，利用生物体产生的一些特殊生物效应（化学反应、热效应、电子效应、压力效应、生物刺激效应）的工作原理杀菌。
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巴氏杀菌的原理：
1、巴氏杀菌是将混合原料加温到68-70度，并保留该温度30分鐘后快速制冷到4-5度。
2、由于一般***的至死点均为温度68度与时长30分钟下列，因此将混合原料经此方法解决后，可消灭在其中的致病性***和绝大部分非致病性***，混合原料加温后忽然制冷，大幅度的热与冷转变还可以促进***的身亡。
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