国内外大量研究表明， 施用生物有机肥可以有效防治土传病害。利用对枯萎病有拮抗作用的多黏类芽孢菌制成的生物有机肥， 其田间防治效果达到73％。由枯草芽孢菌Ⅱ-36 和Ⅰ-23 分别制成的茄子专用生物肥BIO-36 和BIO-23， 经盆栽试验验证，生物菌肥公司，这两种肥料均能有效***茄子青枯病， 防病率分别为96％和91％。目前，生物有机肥在防治蔬菜、水果、***等作物土传病害方面效果十分显著，生物菌肥品牌推荐， 是防治土传病害的一条重要且有效的生态调控防病途径。
生物有机肥就是含有活性有益菌即特定功能微生物且有机质含量达到40%的生物质肥料。生物有机肥也叫微生物菌肥，是农业生产中使用的肥料制品的一种，与化学肥料、有机肥料、绿肥性质不同，它是利用微生物的生命活动及代谢产物的作用，改善作物养分供应，向农作物提供营养元素、生长物质、调控其生长，生物菌肥销售，达到提高产量和品质，减少化肥使用，元阳生物菌肥，提高土壤肥力的目的。
农村生产生物有机肥一般利用农业废弃物经微生物发酵，制得含多种微生物的有机肥。农业废弃物主要是畜禽粪便和秸秆。在水资源丰富的地方，养殖场常使用水冲的方法清理畜禽粪便。有自来水的接上自来水冲洗粪便，没有自来水的在池塘边装上水泵冲洗粪便。冲洗岀来的水大量流入河塘污染环境。有的将粪便收集起来存放在土池中任其沤制，臭气冲天，聚集运至有机肥料厂做原料。使用水冲粪做原料一定亏本。
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