作物施用生物有机肥后， 其中的发酵菌和功能菌大量繁殖， 对改良土壤、促进作物生长、减轻作物病害具有显著效果。主要原因在于：一、肥料中的有益微生物会在土壤中大量定殖形成优势种群， ***其他***微生物的生长繁殖，楚雄微生物菌肥，甚至对部分病原微生物产生拮抗作用，以减少其侵染作物根际的机会。
二、功能菌发挥***增进土壤肥力，比如施用含固氮微生物的肥料，可以增加土壤中的氮素来源；施用含解磷、解钾微生物的肥料，其中的微生物可以将土壤中难溶的磷、钾分解出来，以便作物吸收利用。
三、肥料中的许多微生物菌在生长繁殖过程中会产生对作物有益的代谢产物，能够刺激作物生长，增强作物的抗病抗逆能力。
与单施化肥相比， 生物有机肥的施用可显著增加大白菜和西瓜的直径、单株（果）质量；还可改善番茄、辣椒的品质，使番茄和辣椒中***C 及还原糖的含量增加。通过研究不同施肥方式对生菜品质的影响，微生物菌肥哪家好， 发现施用阿姆斯生物有机肥可使生菜***C 含量增加，总酸降低，糖酸比显著增加，同时可显著降低易诱发***的消酸盐含量，在改善生菜口感、提高产品安全性方面具有重要作用。
微生物菌是生物有机肥料产品的核心，在生产过程中，一般有两个环节涉及到微生物的使用：
一是在腐熟过程中加入促进物料分解、腐熟兼具除臭功能的腐熟菌剂，其多由复合菌系组成，微生物菌肥公司，常见菌有光合菌、乳酸菌、酵母菌、放线、青霉、木霉等；
二是在物料腐熟后加入的功能菌，一般以同氮菌、溶磷菌、硅酸盐***、乳酸菌、假单胞菌、放线等为主，微生物菌肥销售，在产品中发挥特定的肥料效应。因此，对生物有机肥生产来说，微生物菌的筛选、使用是一项核心技术，只有掌握了这一项关键技术，才能加快物料的分解、腐熟，以及保证产品的应用效果。
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